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  1. Article: Processing-bias correction with DEBIAS-M improves cross-study generalization of microbiome-based prediction models.

    Austin, George I / Kav, Aya Brown / Park, Heekuk / Biermann, Jana / Uhlemann, Anne-Catrin / Korem, Tal

    bioRxiv : the preprint server for biology

    2024  

    Abstract: Every step in common microbiome profiling protocols has variable efficiency for each microbe. For example, different DNA extraction kits may have different efficiency for Gram-positive and -negative bacteria. These variable efficiencies, combined with ... ...

    Abstract Every step in common microbiome profiling protocols has variable efficiency for each microbe. For example, different DNA extraction kits may have different efficiency for Gram-positive and -negative bacteria. These variable efficiencies, combined with technical variation, create strong processing biases, which impede the identification of signals that are reproducible across studies and the development of generalizable and biologically interpretable prediction models. "Batch-correction" methods have been used to alleviate these issues computationally with some success. However, many make strong parametric assumptions which do not necessarily apply to microbiome data or processing biases, or require the use of an outcome variable, which risks overfitting. Lastly and importantly, existing transformations used to correct microbiome data are largely non-interpretable, and could, for example, introduce values to features that were initially mostly zeros. Altogether, processing bias currently compromises our ability to glean robust and generalizable biological insights from microbiome data. Here, we present DEBIAS-M (
    Language English
    Publishing date 2024-02-12
    Publishing country United States
    Document type Preprint
    DOI 10.1101/2024.02.09.579716
    Database MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  2. Article: Dentin Bond Strength of Dental Adhesives Functionalized with Polyhedral Oligomeric Silsesquioxanes.

    Biermann, Jana / Bień, Charlyn Elise / Lechte, Clemens / Kanzow, Philipp / Wiegand, Annette

    Materials (Basel, Switzerland)

    2024  Volume 17, Issue 6

    Abstract: This study analyzed the dentin shear bond strength (SBS) of an etch-and-rinse (ER) or a self-etch (SE) adhesive incorporated with multifunctional polyhedral oligomeric silsesquioxanes (MA-POSS-8). An ER adhesive (Solobond Plus, VOCO GmbH, Cuxhaven, ... ...

    Abstract This study analyzed the dentin shear bond strength (SBS) of an etch-and-rinse (ER) or a self-etch (SE) adhesive incorporated with multifunctional polyhedral oligomeric silsesquioxanes (MA-POSS-8). An ER adhesive (Solobond Plus, VOCO GmbH, Cuxhaven, Germany) and a universal adhesive applied in SE mode (Scotchbond Universal, 3M, St. Paul, MN, USA) were infiltrated with MA-POSS-8 (Hybrid Plastics Inc., Hattiesburg, MS, USA) at 5 wt.% or 10 wt.%. Pure adhesives served as controls. Bovine dentin specimens were conditioned with one of the adhesives prior to the application of a nano-hybrid composite (Venus Diamond A3, Kulzer, Hanau, Germany). SBS and failure modes were determined after water storage for 24 h, 6 months, 12 months, or 24 months (each subgroup n = 20). Statistical analysis was performed using ANOVAs, Weibull statistics, and χ
    Language English
    Publishing date 2024-03-13
    Publishing country Switzerland
    Document type Journal Article
    ZDB-ID 2487261-1
    ISSN 1996-1944
    ISSN 1996-1944
    DOI 10.3390/ma17061321
    Database MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  3. Article: Repetitorium: Reparatur von Kompositrestaurationen

    Biermann, Jana / Wiegand, Annette

    Quintessenz Zahnmedizin

    2022  Volume 73, Issue 1, Page(s) 10

    Language German
    Document type Article
    ZDB-ID 2956701-4
    ISSN 2627-9088
    Database Current Contents Medicine

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  4. Book ; Online ; Thesis: Dopplersonografische Untersuchungen zur Durchblutung des Corpus luteum, der Arteria ovarica und der Arteria uterina der Stute unter Einfluss einer postovulatorischen hCG-Behandlung

    Biermann, Jana Teresa

    2013  

    Abstract: Choriongonadotropin, Corpus luteum, Progesteron. - Ziel der vorliegenden Arbeit war es, den Einfluss einer postovulatorischen Behandlung mit humanem Choriongonadotropin (hCG) auf die luteale, ovarielle und uterine Durchblutung, die periphere ... ...

    Title variant humanes Choriongonadotropin
    Author's details vorgelegt von Jana Teresa Biermann
    Abstract Choriongonadotropin, Corpus luteum, Progesteron. - Ziel der vorliegenden Arbeit war es, den Einfluss einer postovulatorischen Behandlung mit humanem Choriongonadotropin (hCG) auf die luteale, ovarielle und uterine Durchblutung, die periphere Progesteronkonzentration im Serum und die Trächtigkeitsrate darzustellen. Hierzu wurden 34 Stuten zu je 50 % mit Frisch- und Tiefgefriersperma besamt und nach der Ovulation (D0) in drei Versuchsgruppen aufgeteilt. Versuchsgruppe eins (n = 12) diente als unbehandelte Kontrollgruppe, Versuchsgruppe zwei (n = 11) erhielt fünf Tage nach Feststellung der Ovulation (D5) eine einmalige Gabe von 2500 IE hCG i.v und Gruppe drei (n = 11) erhielt eine entsprechende Injektion am D11. Alle drei Gruppen wurden ab dem Zeitpunkt der Ovulation bis Stunde zwölf post ovulationem (p.ov.) in vierstündigen, danach bis Tag drei p.ov. in zwölfstündigen Abständen transrektal (Doppler-)sonografisch untersucht. Danach wurde die Kontrollgruppe bis zum 13. Tag p.ov. im 24 Stunden Intervall untersucht. In Gruppe zwei und drei wurde bis zum Zeitpunkt der hCG-Injektion wie in der Kontrollgruppe verfahren. Jeweils post injectionem wurde das kürzere Untersuchungsintervall gewählt, das auch nach der Ovulation zum Einsatz kam. Zu jedem Untersuchungszeitpunkt wurde die Gelbkörpergesamtfläche (ACLgesamt), die durchblutete Gelbkörperfläche (ACLdurchblutet) sowie der Blutfluss in den Aa. ovaricae und Aa. uterinae, durch Berechnung des Blutflussvolumens (BFV) und des Pulsatility Index (PI), bestimmt. Außerdem wurde nach jeder Messung zur Bestimmung der peripheren Progesteronkonzentration mittels Radioimmunoassay (RIA) eine Serumblutprobe aus der V. jugularis externa entnommen. Die Trächtigkeitsrate am Tag 13 p.ov. in Gruppe eins lag bei...
    Language German
    Size Online-Ressource (VII, 148 S. = 3.518 kb, text), Ill., graph. Darst.
    Publisher Tierärztl. Hochsch
    Publishing place Hannover
    Document type Book ; Online ; Thesis
    Thesis / German Habilitation thesis @Hannover, Tierärztl. Hochsch., Diss., 2013
    Note Sprache der Zusammenfassung: Englisch
    Database Special collection on veterinary medicine and general parasitology

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  5. Article ; Online: Questionnaire Survey on the Management of Erosive Tooth Wear.

    Kanzow, Philipp / Biermann, Jana / Wiegand, Annette

    Oral health & preventive dentistry

    2019  Volume 17, Issue 3, Page(s) 227–234

    Abstract: Purpose: This questionnaire survey aimed to analyse management strategies for erosive tooth wear and to identify factors influencing dentists' decision-making.: Materials and methods: A questionnaire presenting clinical cases with erosive tooth wear ... ...

    Abstract Purpose: This questionnaire survey aimed to analyse management strategies for erosive tooth wear and to identify factors influencing dentists' decision-making.
    Materials and methods: A questionnaire presenting clinical cases with erosive tooth wear on anterior and posterior teeth (BEWE scores 1 to 3) was sent electronically to German dentists (n = 13.683). Statistical analysis was performed by Wilcoxon signed-rank tests, Kruskal-Wallis-tests and Fisher's exact tests (p <0.05).
    Results: Only 455 dentists (3.3%, mean age: 52.3 ± 9.6) participated. Suggested therapeutic measures were statistically significantly different between BEWE 1, 2 and 3 (p <0.001) and between anterior and posterior teeth with BEWE scores 1 or 2 (p ≤0.025). Initial erosive lesions (BEWE 1) were mainly treated by information about the main causes and/or preventive measures (posterior teeth: 75.6%, anterior teeth: 64.4%), only 20.0% and 31.3% considered restorative treatment for posterior and anterior teeth, respectively. For teeth presenting score 2, a very high proportion of dentists considered restorative treatment (posterior teeth: 60.6%) additionally to prevention, especially when anterior teeth (91.0%) were affected. In case of severe erosive lesions (BEWE 3), the vast majority of dentists considered restorative treatment (posterior teeth: 98.3%, anterior teeth: 99.8%). The decision-making was mainly dependent on the lesion depth, size of affected surfaces and the presence of pain. Fluoride agents and agents containing tin chloride or tin fluoride were most frequently recommended as preventive measures. If distinct defects (BEWE 2) were treated restoratively, mainly composite restorations were performed (posterior teeth: 72.0%, anterior teeth: 90.5%). Severe defects (BEWE 3) were mostly restored with ceramic restorations (posterior teeth: 66.1%, anterior teeth: 66.6%).
    Conclusion: Stepwise management of erosive tooth wear was observed. Dentists' decision-making was related to severity and localisation of erosive tooth wear and to various patient-related factors (e.g. depth of lesion and size of affected surface per tooth).
    MeSH term(s) Adult ; Dentists ; Fluorides ; Humans ; Middle Aged ; Surveys and Questionnaires ; Tooth Erosion ; Tooth Wear
    Chemical Substances Fluorides (Q80VPU408O)
    Language English
    Publishing date 2019-02-02
    Publishing country Germany
    Document type Journal Article
    ZDB-ID 2136786-3
    ISSN 1757-9996 ; 1602-1622
    ISSN (online) 1757-9996
    ISSN 1602-1622
    DOI 10.3290/j.ohpd.a41811
    Database MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  6. Book ; Audio / Video: Erstversorgung des neonaten Fohlens

    Biermann, Jana

    2008  

    Author's details J. Biermann
    Language German
    Size 1 CD-ROM, 12 cm
    Publisher Klinik für Pferde der Tierärztl. Hochschule
    Publishing place Hannover
    Document type Book ; Audio / Video
    Database Special collection on veterinary medicine and general parasitology

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  7. Book ; Online ; Thesis: Auswirkungen verschiedener Nabeldesinfektionsmittel auf die klinische und sonographische Entwicklung des Nabels beim neonaten Fohlen

    Biermann, Jana

    2008  

    Author's details vorgelegt von Jana Biermann
    Language German
    Size Online-Ressource
    Document type Book ; Online ; Thesis
    Thesis / German Habilitation thesis Tierärztliche Hochsch., Diss--Hannover, 2008
    Database Special collection on veterinary medicine and general parasitology

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  8. Book ; Online ; Conference proceedings ; Thesis: Auswirkungen verschiedener Nabeldesinfektionsmittel auf die klinische und sonographische Entwicklung des Nabels beim neonaten Fohlen

    Biermann, Jana

    2008  

    Abstract: Nabel, Fohlen, Infektionsprophylaxe. - Nabelentzündungen sind ein häufig auftretendes Problem neonater Fohlen. Bei einer Infektion der Nabelstrukturen besteht das Risiko einer sich systemisch manifestierenden Infektion. Das Ziel dieser Studie war es, die ...

    Event/congress Online-Publikation
    Author's details vorgelegt von Jana Biermann
    Abstract Nabel, Fohlen, Infektionsprophylaxe. - Nabelentzündungen sind ein häufig auftretendes Problem neonater Fohlen. Bei einer Infektion der Nabelstrukturen besteht das Risiko einer sich systemisch manifestierenden Infektion. Das Ziel dieser Studie war es, die Wirksamkeit verschiedener Nabeldesinfektions-mittel im Rahmen der Infektionsprophylaxe beim Fohlen zu überprüfen. Zu diesem Zweck wurden fünf verschiedene Desinfektions-protokolle am Nabel von insgesamt 98 Fohlen desselben Gestütes angewendet. Für die Desinfektion wurden Chlorhexidin (1%ig, 5 Tage 2x tägl.), PVP-Jodlösung (1%ig, 5 Tage 2x tägl.), PVP-Jodlösung (2%ig) mit zwei unterschiedlichen Anwendungsprotokollen (5 Tage 1x tägl. oder 3x am ersten Lebenstag) und eine ethanolhaltige Jodlösung (1%ig, 5 Tage 2x tägl.) eingesetzt. Die Fohlen und insbesondere deren Nabel wurden in den ersten acht Lebenstagen täglich klinisch und zweimal sonographisch unter-sucht. Klinisch wurden Durchmesser und Feuchtigkeit des Nabels dokumentiert. Die Fohlen wurden entsprechend dem Feuchtigkeits-zustand ihres Nabels einer von drei Kategorien (trocken ab Lebenstag 2, feucht und nicht behandlungsbedürftig und feucht und be-handlungsbedürftig) zugeteilt. Sonographisch wurden Messungen der intraabdominalen Nabelstrukturen an festgelegten Schnittebenen am zweiten und am achten Lebenstag durchgeführt. Das Auftreten von Omphalitis und die Art der Behandlung wurden dokumentiert. Zum Durchmesser des äußeren Nabels wurden keine signifikanten Unterschiede zwischen den Nabeldipp-Gruppen beobachtet. Im Mittel wurden hier gruppenübergreifend am ersten Lebenstag 1,5 ± 0,3 cm und am siebten Lebenstag 1,2 ± 0,3 cm dokumentiert. Der Unterschied zwischen Lebenstag 1 und Lebenstag 7 war innerhalb jeder Gruppe signifikant. Bei Fohlen mit einer Omphalitis war der Nabel ab dem zweiten Lebenstag und insbesondere am vierten Lebenstag signifikant größer als bei Fohlen ohne entzündliche Ver-änderung des Nabels. Fohlen, bei denen der Nabel mit alkoholischer Jodlösung gedippt wurde, zeigten häufiger (50 % entsprechend 9 von 18 Fohlen) einen feuchten Nabel als Fohlen der anderen Gruppen. Sonographisch wurde ermittelt, dass der Durchmesser der Nabelvene im Bereich unmittelbar kaudal der Leber bei dorso-ventraler Messung (von 5,6 ± 1,4 mm zu 5,1 ± 1,3 mm) und bei latero-lateraler Messung (von 8,1 ± 1,7 mm zu 6,9 ± 1,3 mm) innerhalb der ersten Lebenswoche signifikant abnahm. Der dorso-ventrale Durchmesser der Nabelvene unmittelbar kranial des Nabelstumpfes nahm von 7,1 ± 2 mm zu 6,4 ± 1,5 mm signifikant ab. Auch der latero-laterale Durchmesser nahm von 9,9 ± 2,5 mm zu 8,3 ± 1,7 mm signifikant ab. Die Nabelarterien zeigten keine klinisch relevanten Veränderungen ihres Durchmessers innerhalb der ersten Lebens-woche. Hinsichtlich des Urachus wurde in der sonographischen Untersuchung nur der Befund erkrankt oder nicht erkrankt erhoben. Hier zeigten signifikant mehr Fohlen mit dem Nabeldipp einer zweiprozentigen PVP-Jodlösung (5 Tage 1x täglich angewendet) am zweiten Lebenstag eine Urachitis als Fohlen, deren Nabel in den ersten fünf Lebenstagen zweimal täglich mit einprozentiger alkoho-lischer Jodlösung gedippt wurde. Urachitiden waren die am häufigsten sonographisch diagnostizierten Nabelerkrankungen (n = 14), gefolgt von Omphalophlebitiden (n = 10) und Omphaloarteriitiden (n = 2) und patentem Urachus (n = 1). Von den 98 Fohlen der Studie wurden insgesamt 32 Fohlen aufgrund einer Nabelinfektion medikamentös behandelt. Mit 65 % behandelten Fohlen in der Gruppe mit 2%iger PVP-Jodlösung einmal täglich über 5 Tage, 24 % behandelten Fohlen in der Gruppe mit dreimalig am ersten Lebenstag angewendeter 2%iger PVP-Jodlösung, 32 % behandelten Fohlen in der Gruppe mit 1%iger PVP-Jodlösung, 28 % behandelten Fohlen in der Gruppe mit alkoholischer Jodlösung und 15 % behandelten Fohlen der Chlorhexidin-Gruppe bestand ein signifikanter Unterschied in der Behandlungsrate zwischen den fünf Gruppen. Dabei schnitt die Gruppe, in der die zweiprozentige PVP-Jodlösung 1x täglich über 5 Tage verwendet wurde, mit Abstand am schlechtesten ab. Das Ergebnis dieser Gruppe war mit 65 % zu behandelnden Fohlen signifikant schlechter als das Ergebnis der Chlorhexidin-Gruppe und schwach signifikant schlechter als die Ergebnisse der Gruppen, in denen der Fohlennabel mit alkoholischer Jodlösung oder mit zweiprozentiger PVP-Jodlösung nur am ersten Lebenstag gedippt wurde. In der Chlorhexidin-Gruppe wurden drei Fohlen aufgrund einer Nabelinfektion einer Resektion der Nabelstrukturen unterzogen; zwei dieser Fohlen erkrankten allerdings erstmals im zweiten Lebensmonat. In der Gruppe, in der die 2%ige PVP-Jodlösung nur am ersten Lebenstag verwendet wurde, wurden bei einem Fohlen mit einer Urachusfistel die Nabelstrukturen chirurgisch entfernt. Durch die niedrige Erkrankungsrate der Chlorhexidin-Gruppe kann dieses Präparat für die Desinfektion des Fohlennabels empfohlen werden. PVP-Jodlösungen in Konzentrationen über 1 % werden aufgrund der hohen Nabelerkrankungsrate nach der Verwendung dieses Nabeldipps als nicht geeignet befunden, um den Nabel des neonaten Fohlens zu desinfizieren. Bei Verwendung von Jodlösungen sollte auf die alkoholische Jodlösung zurückgegriffen werden oder die PVP-Jodlösungen sollten entsprechend auf eine geeignete Konzentration (0,1 bis 1 %) eingestellt werden.
    Language German
    Size Online-Ressource (127 S. = 744 Kb, text), Ill., graph. Darst
    Publisher Tierärztl. Hochsch
    Publishing place Hannover
    Document type Book ; Online ; Conference proceedings ; Thesis
    Thesis / German Habilitation thesis @Hannover, Tierärztl. Hochsch., Klinik für Pferde, Diss., 2008
    Database Special collection on veterinary medicine and general parasitology

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  9. Article ; Online: Risk factors for repeated general anesthesia for dental treatment of adult patients with intellectual and/or physical disabilities.

    Maes, Mona Shaghayegh / Kanzow, Philipp / Biermann, Jana / Leha, Andreas / Hrasky, Valentina / Wiegand, Annette

    Clinical oral investigations

    2021  Volume 26, Issue 2, Page(s) 1695–1700

    Abstract: Aim: Repeated dental treatment of patients with intellectual and/or physical disabilities under general anesthesia (GA) often becomes necessary. This study aimed to identify potential risk factors predictive of repeated dental treatment under general ... ...

    Abstract Aim: Repeated dental treatment of patients with intellectual and/or physical disabilities under general anesthesia (GA) often becomes necessary. This study aimed to identify potential risk factors predictive of repeated dental treatment under general anesthesia.
    Materials and methods: Data of adult patients with intellectual and/or physical disabilities receiving dental treatment under GA within a time period of 7 years were analyzed (n = 203, mean age: 41.0 ± 14.9 years). All patients received comprehensive dental treatment (professional tooth cleaning, periodontal therapy, composite restorations, and/or extractions); patients receiving extractions only for emergency dental care were not included as a second intervention for restorative treatment often followed. Demographic, anamnestic, oral health, and treatment factors were obtained from dental records. Duration of intervals without dental treatment under GA was assessed using Kaplan-Meier statistics. Potential predictive factors were tested using univariate and multivariate cox regression analyses.
    Results: Thirty-five patients (17.2%) received a second and five patients (2.5%) a third dental treatment under GA during that period. In the univariate analysis, patients' age, living situation, and nutrition were associated with repeated GA. In the multivariate Cox regression analysis, only nutrition remained significant. Risk for repeated treatment increased if patients were tube-fed (HR: 7.54, p = 0.001) or received pureed/liquid food (HR: 4.32, p = 0.007) compared to nutrition without limitation.
    Conclusion: In adult patients with intellectual and/or physical disabilities, nutrition affects the risk for repeated dental treatment under GA.
    Clinical relevance: Identification of risk factors making repeated dental treatment under GA of patients with intellectual and/or physical disabilities more likely is essential to adjust preventive measures.
    MeSH term(s) Adult ; Anesthesia, Dental ; Anesthesia, General ; Dental Care ; Dental Caries ; Humans ; Middle Aged ; Oral Health ; Retrospective Studies ; Risk Factors
    Language English
    Publishing date 2021-08-25
    Publishing country Germany
    Document type Journal Article
    ZDB-ID 1364490-7
    ISSN 1436-3771 ; 1432-6981
    ISSN (online) 1436-3771
    ISSN 1432-6981
    DOI 10.1007/s00784-021-04142-w
    Database MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  10. Book ; Thesis: Dopplersonografische Untersuchungen zur Durchblutung des Corpus luteum, der Arteria ovarica und der Arteria uterina der Stute unter Einfluss einer postovulatorischen hCG-Behandlung

    Biermann, Jana Teresa

    2013  

    Title variant humanes Choriongonadotropin
    Author's details vorgelegt von Jana Teresa Biermann
    Language German
    Size VII, 148 S., Ill., graph. Darst.
    Document type Book ; Thesis
    Thesis / German Habilitation thesis @Hannover, Tierärztl. Hochsch., Diss., 2013
    Note Sprache der Zusammenfassung: Englisch
    Database Special collection on veterinary medicine and general parasitology

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