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  1. Artikel ; Online: ecDNAs personify cancer gangsters.

    Keshavarzian, Tina / Lupien, Mathieu

    Molecular cell

    2022  Band 82, Heft 3, Seite(n) 500–502

    Abstract: Alterations to gene regulatory plexuses typify oncogenesis, and two recent studies from Hung, Yost, Xie et al. (Hung et al., 2021) and Yi et al. (2021) collectively reveal the competitive advantage of extrachromosomal DNAs (ecDNAs) to set their own rules ...

    Abstract Alterations to gene regulatory plexuses typify oncogenesis, and two recent studies from Hung, Yost, Xie et al. (Hung et al., 2021) and Yi et al. (2021) collectively reveal the competitive advantage of extrachromosomal DNAs (ecDNAs) to set their own rules to control transcription by clustering into ecDNA hubs through intermolecular interactions that forge hub-specific regulatory plexuses driving high-oncogene expression.
    Mesh-Begriff(e) Carcinogenesis/genetics ; Humans ; Neoplasms/genetics ; Oncogenes
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2022-02-04
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't ; Comment
    ZDB-ID 1415236-8
    ISSN 1097-4164 ; 1097-2765
    ISSN (online) 1097-4164
    ISSN 1097-2765
    DOI 10.1016/j.molcel.2022.01.003
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Volltext online

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Verfügbar in ZB MED Köln/Königswinter

    Zs.A 5055: Hefte anzeigen Standort:
    Je nach Verfügbarkeit (siehe Angabe bei Bestand)
    bis Jg. 1994: Bestellungen von Artikeln über das Online-Bestellformular
    Jg. 1995 - 2021: Lesesall (2.OG)
    ab Jg. 2022: Lesesaal (EG)

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  2. Artikel: ecDNAs personify cancer gangsters

    Keshavarzian, Tina / Lupien, Mathieu

    Molecular cell. 2022 Feb. 03, v. 82, no. 3

    2022  

    Abstract: Alterations to gene regulatory plexuses typify oncogenesis, and two recent studies from Hung, Yost, Xie et al. (Hung et al., 2021) and Yi et al. (2021) collectively reveal the competitive advantage of extrachromosomal DNAs (ecDNAs) to set their own rules ...

    Abstract Alterations to gene regulatory plexuses typify oncogenesis, and two recent studies from Hung, Yost, Xie et al. (Hung et al., 2021) and Yi et al. (2021) collectively reveal the competitive advantage of extrachromosomal DNAs (ecDNAs) to set their own rules to control transcription by clustering into ecDNA hubs through intermolecular interactions that forge hub-specific regulatory plexuses driving high-oncogene expression.
    Schlagwörter DNA ; carcinogenesis ; cells ; chemical interactions ; neoplasms ; plexus ; regulator genes
    Sprache Englisch
    Erscheinungsverlauf 2022-0203
    Umfang p. 500-502.
    Erscheinungsort Elsevier Inc.
    Dokumenttyp Artikel
    ZDB-ID 1415236-8
    ISSN 1097-4164 ; 1097-2765
    ISSN (online) 1097-4164
    ISSN 1097-2765
    DOI 10.1016/j.molcel.2022.01.003
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

    Volltext online

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Verfügbar in ZB MED Bonn

    Z 2005/501: Hefte anzeigen

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  3. Artikel ; Online: Transposable Elements Are Co-opted as Oncogenic Regulatory Elements by Lineage-Specific Transcription Factors in Prostate Cancer.

    Grillo, Giacomo / Keshavarzian, Tina / Linder, Simon / Arlidge, Christopher / Mout, Lisanne / Nand, Ankita / Teng, Mona / Qamra, Aditi / Zhou, Stanley / Kron, Ken J / Murison, Alex / Hawley, James R / Fraser, Michael / van der Kwast, Theodorus H / Raj, Ganesh V / He, Housheng Hansen / Zwart, Wilbert / Lupien, Mathieu

    Cancer discovery

    2023  Band 13, Heft 11, Seite(n) 2470–2487

    Abstract: Transposable elements hold regulatory functions that impact cell fate determination by controlling gene expression. However, little is known about the transcriptional machinery engaged at transposable elements in pluripotent and mature versus oncogenic ... ...

    Abstract Transposable elements hold regulatory functions that impact cell fate determination by controlling gene expression. However, little is known about the transcriptional machinery engaged at transposable elements in pluripotent and mature versus oncogenic cell states. Through positional analysis over repetitive DNA sequences of H3K27ac chromatin immunoprecipitation sequencing data from 32 normal cell states, we report pluripotent/stem and mature cell state-specific "regulatory transposable elements." Pluripotent/stem elements are binding sites for pluripotency factors (e.g., NANOG, SOX2, OCT4). Mature cell elements are docking sites for lineage-specific transcription factors, including AR and FOXA1 in prostate epithelium. Expanding the analysis to prostate tumors, we identify a subset of regulatory transposable elements shared with pluripotent/stem cells, including Tigger3a. Using chromatin editing technology, we show how such elements promote prostate cancer growth by regulating AR transcriptional activity. Collectively, our results suggest that oncogenesis arises from lineage-specific transcription factors hijacking pluripotent/stem cell regulatory transposable elements.
    Significance: We show that oncogenesis relies on co-opting transposable elements from pluripotent stem cells as regulatory elements altering the recruitment of lineage-specific transcription factors. We further discover how co-option is dependent on active chromatin states with important implications for developing treatment options against drivers of oncogenesis across the repetitive DNA. This article is featured in Selected Articles from This Issue, p. 2293.
    Mesh-Begriff(e) Male ; Humans ; Transcription Factors/genetics ; Transcription Factors/metabolism ; DNA Transposable Elements/genetics ; Cell Differentiation ; Chromatin/genetics ; Prostatic Neoplasms/genetics ; Carcinogenesis/genetics
    Chemische Substanzen Transcription Factors ; DNA Transposable Elements ; Chromatin
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2023-09-11
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't
    ZDB-ID 2625242-9
    ISSN 2159-8290 ; 2159-8274
    ISSN (online) 2159-8290
    ISSN 2159-8274
    DOI 10.1158/2159-8290.CD-23-0331
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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    Kategorien

    Verfügbar in ZB MED Köln/Königswinter

    Zs.A 6916: Hefte anzeigen Standort:
    Je nach Verfügbarkeit (siehe Angabe bei Bestand)
    bis Jg. 2021: Bestellungen von Artikeln über das Online-Bestellformular
    ab Jg. 2022: Lesesaal (EG)

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