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Article: Fusogenicity of the Ghana Virus (Henipavirus: Ghanaian bat henipavirus) Fusion Protein is Controlled by the Cytoplasmic Domain of the Attachment Glycoprotein

Hoffmann, Markus / Mueller, Marcel / Drosten, Christian / Krüger, Nadine

Viruses, 11(9):800

2019

Abstract: The Ghana virus (GhV) is phylogenetically related to the zoonotic henipaviruses Nipah (NiV) and Hendra virus. Although GhV uses the highly conserved receptor ephrin-B2, the fusogenicity is restricted to cell lines of bat origin. Furthermore, the surface ... ...

Institution	Charité - Universitätsmedizin Berlin Deutsches Primatenzentrum (Göttingen)
Abstract	The Ghana virus (GhV) is phylogenetically related to the zoonotic henipaviruses Nipah (NiV) and Hendra virus. Although GhV uses the highly conserved receptor ephrin-B2, the fusogenicity is restricted to cell lines of bat origin. Furthermore, the surface expression of the GhV attachment glycoprotein (G) is reduced compared to NiV and most of this protein is retained in the endoplasmic reticulum (ER). Here, we generated truncated as well as chimeric GhV G proteins and investigated the influence of the structural domains (cytoplasmic tail, transmembrane domain, ectodomain) of this protein on the intracellular transport and the fusogenicity following coexpression with the GhV fusion protein (F). We demonstrate that neither the cytoplasmic tail nor the transmembrane domain is responsible for the intracellular retention of GhV G. Furthermore, the cytoplasmic tail of GhV G modulates the fusogenicity of GhV F and therefore controls the species-restricted fusogenicity of the GhV surface glycoproteins.
Keywords	Coronavirus ; Ghana virus ; attachment glycoprotein ; fusion ; intracellular retention
Language	English
Document type	Article
Database	Repository for Life Sciences

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Article ; Online: Development of novel ligands against SARS-CoV-2 M

Kaboudi, Navid / Krüger, Nadine / Hamzeh-Mivehroud, Maryam

Molecular informatics

2023 Volume 42, Issue 11, Page(s) e202300120

Abstract: Background: Despite tremendous efforts made by scientific community during the outbreak of COVID-19 pandemic, this disease still remains as a public health concern. Although different types of vaccines were globally used to reduce the mortality, ... ...

Abstract	Background: Despite tremendous efforts made by scientific community during the outbreak of COVID-19 pandemic, this disease still remains as a public health concern. Although different types of vaccines were globally used to reduce the mortality, emergence of new variants of SARS-CoV-2 is a challenging issue in COVID-19 pharmacotherapy. In this context, target therapy of SARS-CoV-2 by small ligands is a promising strategy. Methods: In this investigation, we applied ligand-based virtual screening for finding novel molecules based on nirmatrelvir structure. Various criteria including drug-likeness, ADME, and toxicity properties were applied for filtering the compounds. The selected candidate molecules were subjected to molecular docking and dynamics simulation for predicting the binding mode and binding free energy, respectively. Then the molecules were experimentally evaluated in terms of antiviral activity against SARS-CoV-2 and toxicity assessment. Results: The results demonstrated that the identified compounds showed inhibitory activity towards SARS-CoV-2 M Conclusion: In summary, the introduced compounds may provide novel scaffold for further structural modification and optimization with improved anti SARS-CoV-2 M
MeSH term(s)	Humans ; SARS-CoV-2 ; COVID-19 ; Ligands ; Molecular Docking Simulation ; Pandemics
Chemical Substances	Ligands
Language	English
Publishing date	2023-09-06
Publishing country	Germany
Document type	Journal Article
ZDB-ID	2537668-8
ISSN	1868-1751 ; 1868-1743
ISSN (online)	1868-1751
ISSN	1868-1743
DOI	10.1002/minf.202300120
Database	MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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Article ; Online: Nafamostat-Mediated Inhibition of SARS-CoV-2 Ribosomal Frameshifting Is Insufficient to Impair Viral Replication in Vero Cells. Comment on Munshi et al. Identifying Inhibitors of -1 Programmed Ribosomal Frameshifting in a Broad Spectrum of Coronaviruses.

Jäger, Niklas / Hoffmann, Markus / Pöhlmann, Stefan / Krüger, Nadine

Viruses

2022 Volume 14, Issue 7

Abstract: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent of the ongoing coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, which has been reported to have caused 18 [ ... ]. ...

Abstract	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent of the ongoing coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, which has been reported to have caused 18 [...].
MeSH term(s)	Animals ; Benzamidines ; COVID-19 ; Chlorocebus aethiops ; Frameshifting, Ribosomal ; Guanidines ; Humans ; SARS-CoV-2/genetics ; Vero Cells ; Virus Replication
Chemical Substances	Benzamidines ; Guanidines ; nafamostat (Y25LQ0H97D)
Language	English
Publishing date	2022-07-13
Publishing country	Switzerland
Document type	Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't ; Comment
ZDB-ID	2516098-9
ISSN	1999-4915 ; 1999-4915
ISSN (online)	1999-4915
ISSN	1999-4915
DOI	10.3390/v14071526
Database	MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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Article: Nafamostat-Mediated Inhibition of SARS-CoV-2 Ribosomal Frameshifting Is Insufficient to Impair Viral Replication in Vero Cells. Comment on Munshi et al. Identifying Inhibitors of −1 Programmed Ribosomal Frameshifting in a Broad Spectrum of Coronaviruses. Viruses 2022, 14, 177

Jäger, Niklas / Hoffmann, Markus / Pöhlmann, Stefan / Krüger, Nadine

Viruses. 2022 July 13, v. 14, no. 7

2022

Abstract	Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is the causative agent of the ongoing coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, which has been reported to have caused 18 [...]
Keywords	COVID-19 infection ; Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 ; etiological agents ; pandemic ; virus replication
Language	English
Dates of publication	2022-0713
Publishing place	Multidisciplinary Digital Publishing Institute
Document type	Article
ZDB-ID	2516098-9
ISSN	1999-4915
ISSN	1999-4915
DOI	10.3390/v14071526
Database	NAL-Catalogue (AGRICOLA)

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Book ; Online ; Thesis: Untersuchungen zur Interspezies-Übertragung fledertierassoziierter RNS-Viren

Krüger, Nadine [Verfasser]

2019

Author's details	Nadine Krüger
Keywords	Landwirtschaft, Veterinärmedizin ; Agriculture, Veterinary Science
Subject code	sg630
Language	German
Publisher	Stiftung Tierärztliche Hochschule Hannover
Publishing place	Hannover
Document type	Book ; Online ; Thesis
Database	Digital theses on the web

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Article ; Online: Influence of antiresorptive/antiangiogenic therapy on the surgical treatment outcomes of experimentally induced peri-implantitis lesions.

Ramanauskaite, Ausra / Krüger, Nadine / Obreja, Karina / Borchert, Fanya / Dahmer, Iulia / Schwarz, Frank

Clinical oral investigations

2023 Volume 27, Issue 11, Page(s) 6657–6666

Abstract: Objective: To investigate the influence of various antiresorptive and antiangiogenic medications on the resolution of experimentally induced peri-implantitis lesions after different surgical treatment approaches.: Materials and methods: Forty-eight ... ...

Abstract	Objective: To investigate the influence of various antiresorptive and antiangiogenic medications on the resolution of experimentally induced peri-implantitis lesions after different surgical treatment approaches. Materials and methods: Forty-eight albino rats randomly received a dual application of the following medications: (1) amino-bisphosphonate (zoledronate (Zo)) (n = 8), (2) RANKL inhibitor (denosumab (De)) (n = 8), (3) antiangiogenic (bevacizumab (Be)) (n = 8), (4) Zo + Be (n = 8), (5) De + Be (n = 8), or (6) no medication (control (Co)) (n = 8). Ligature-induced peri-implantitis lesions were established at 2 maxillary implants over 16 weeks. Afterward, animals were randomly treated either with open flap debridement (OFD) or reconstructive therapy (RT). Treatment procedures were followed by a 12-week healing period. The histological outcomes included residual defect length (DL); defect width (DW) at the bone crest (BC-DW); 25%, 50%, and 75% of the DL; and areas of inflammatory cell infiltrate (ICT). When present, areas of bone sequester (BS) were assessed considering the animal as a statistical unit. Results: A total of 21 animals were analyzed (Zo: RT = 3, OFD = 1; De: RT = 3, OFD = 2; Be: OFD = 1; Zo + Be: RT = 2, OFD = 2; Co: RT = 3, OFD = 2). Implant loss rates were comparable among the experimental groups. Except for the 25% and 75% DW values that were significantly higher in the Zo + Be group compared to the Co group (p = 0.04 and p = 0.03, respectively), no significant differences were found among the experimental groups for the DL (lowest-Be: 0.56 mm; highest-Co: 1.05 mm), BC-DW (lowest-De: 0.86 mm, highest-Co: 1.07 mm), 50% DW (lowest-De: 0.86 mm; highest-Be + Zo: 1.29 mm), and ICT (lowest-Be: 0.56 mm Conclusions: The present findings did not reveal a marked effect of various antiresorptive/antiangiogenic medications on the resolution of experimentally induced peri-implantitis lesions, regardless of the surgical approach employed (OFD and RT). Clinical relevance: Resolution of peri-implantitis lesions may not be affected by the investigated antiresorptive/antiangiogenic medications.
MeSH term(s)	Animals ; Peri-Implantitis/therapy ; Dental Implants ; Treatment Outcome ; Plastic Surgery Procedures ; Surgical Flaps/surgery
Chemical Substances	Dental Implants
Language	English
Publishing date	2023-10-02
Publishing country	Germany
Document type	Journal Article
ZDB-ID	1364490-7
ISSN	1436-3771 ; 1432-6981
ISSN (online)	1436-3771
ISSN	1432-6981
DOI	10.1007/s00784-023-05275-w
Database	MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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Book: Leitfaden für abgestimmte Modernisierungsempfehlungen bei Nichtwohngebäuden unter besonderer Berücksichtigung der Fassade

Krüger, Nadine

[Endbericht]

(Forschungsinitiative ZukunftBau : F ; 2842)

2013

Institution	Bundesinstitut für Bau-, Stadt- und Raumforschung
Author's details	Bundesinstitut für Bau-, Stadt- und Raumforschung im Bundesamt für Bauwesen und Raumordnung. Nadine Krüger
Series title	Forschungsinitiative ZukunftBau : F ; 2842
Keywords	Modernisierung ; Energiebewusstes Bauen ; Fassade ; Nichtwohngebäude
Language	German
Size	61, 247 S., Ill., zahlr. graph. Darst., 30 cm
Publisher	Fraunhofer-IRB-Verl
Publishing place	Stuttgart
Document type	Book
Note	Hergestellt on demand. - Literaturangaben
ISBN	9783816789642 ; 3816789641
Database	Library catalogue of the German National Library of Science and Technology (TIB), Hannover

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Book ; Online ; Thesis: Interaction of bat-derived paramyxoviruses with chiropteran and non-chiropteran cells

Herrler, Georg / Krüger, Nadine

functional characterization of the African henipavirus and bat-derived mumps virus fusion and attachment glycoproteins

2014

Abstract: Fledertiere-assoziierte Paramyxoviren, Viruseintritt, Zoonosen. - Ziel dieser Arbeit, die sich mit der funktionellen Charakterisierung der Oberflächenglykoproteine von zwei, in afrikanischen Fledertieren nachgewiesenen Paramyxoviren - einem afrikanischen ...

Author's details	by Nadine Krüger
Abstract	Fledertiere-assoziierte Paramyxoviren, Viruseintritt, Zoonosen. - Ziel dieser Arbeit, die sich mit der funktionellen Charakterisierung der Oberflächenglykoproteine von zwei, in afrikanischen Fledertieren nachgewiesenen Paramyxoviren - einem afrikanischen Henipavirus (M74) und einem fledertier-assoziierten Mumpsvirus (batMuV), deren RNS in Flughunden gefunden wurden - befasst, ist es, eine Aussage über das zoonotische Potential dieser Paramyxoviren sowie über ihre Verwandtschaft zu dem Nipah-Virus (NiV), einem zoonotischen Vertreter der Henipaviren, bzw. dem humanen Mumpsvirus (hMuV) zu machen. Diese Fragestellung ist von besonderem Interesse, da für NiV und hMuV bekannt ist, dass sie zu klinischen Infektionen in Menschen führen können und im Falle von NiV eine Übertragung von Flughunden auf den Menschen stattfand. Hinsichtlich des afrikanischen Henipavirus M74 konnte gezeigt werden, dass das rezeptorbindende Glykoprotein (G) in der Lage ist, mit dem zellulären Henipavirusrezeptor zu interagieren. Zudem weist die proteolytische Spaltung des Fusionsproteins (F) Ähnlichkeiten zu dem korrespondierenden Protein von NiV auf. Die Bildung von Riesenzellen, welche durch die Coexpression von den beiden Glykoproteinen F und G induziert wird und ein typischer zytopathogener Effekt von Paramyxoviren ist, war im Falle der beiden M74-Glykoproteinen auf Zelllinien von Fledertieren beschränkt. Weitere Versuche ergaben, dass insbesondere ein ineffizienter zellulärer Transport des G Proteins an die Zelloberfläche für die eingeschränkte funktionelle Aktivität verantwortlich ist. Die funktionelle Aktivität des Fusions- (F) und des Hämagglutinin-Neuraminidase- (HN) Glykoproteins des Fledertier-Mumpsvirus, wurde durch den Nachweis von Zell-zu-Zell Fusion in verschiedenen Säugetierzelllinien, einschließlich humanen Zellen, nachgewiesen. Zudem waren die batMuV Glykoproteine in der Lage mit humanen MuV-Glycoproteinen zu interagieren und die Bildung von Riesenzellen hervorzurufen. Die Expression von chimären F Proteinen zeigte, dass das Signalpeptid für die Größe der Riesenzellen, womit in diesem Fall die Anzahl der Zellkerne innerhalb einer Zytoplasmamembran gemeint ist, verantwortlich ist. Desweiteren wurde nachgewiesen, dass das batMuV HN Protein an Sialinsäuren bindet und hämadsorbierende Eigenschaften besitzt, während keine Neuraminidaseaktivität nachgewiesen werden konnte. In dieser Arbeit wurde gezeigt, dass beide fledertier-assoziierte Paramyxoviren funktionelle Ähnlichkeiten zu NiV bzw. hMuV aufweisen, sodass ein grundsätzliches zoonotisches Potential vorhanden ist. Solange allerdings nur Virussequenzen und keine Virusisolate verfügbar sind, können keine genauen Angaben über das tatsächliche Gefahrenpotential einer Infektion des Menschen bzw. einer Mensch-zu-Mensch-Übertragung gemacht werden. Durch die verwendeten in vitro-Techniken konnten jedoch bereits bedeutende Erkenntnisse über die Virus-Wirts-Interaktion der untersuchten fledertier-assoziierten Paramyxoviren gewonnen werden und damit bereits elementare Grundlagen für die Evaluierung ihres zoonotischen Potentials geleistet werden.
Language	English
Size	Online-Ressource (VIII, 154 S. = 18.551 kb, text), Ill., graph. Darst., Kt.
Publisher	Tierärztl. Hochsch
Publishing place	Hannover
Document type	Book ; Online ; Thesis
Thesis / German Habilitation thesis	Tierärztl. Hochsch., Inst. of Virology, Ph.D. Diss.--Hannover, 2014
Database	Special collection on veterinary medicine and general parasitology

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Book ; Online ; Thesis: Interaction of bat-derived paramyxoviruses with chiropteran and non-chiropteran cells

Herrler, Georg / Krüger, Nadine

functional characterization of the African henipavirus and bat-derived mumps virus fusion and attachment glycoproteins

2014

Author's details	by Nadine Krüger
Abstract	Fledertiere-assoziierte Paramyxoviren, Viruseintritt, Zoonosen. - Ziel dieser Arbeit, die sich mit der funktionellen Charakterisierung der Oberflächenglykoproteine von zwei, in afrikanischen Fledertieren nachgewiesenen Paramyxoviren - einem afrikanischen Henipavirus (M74) und einem fledertier-assoziierten Mumpsvirus (batMuV), deren RNS in Flughunden gefunden wurden - befasst, ist es, eine Aussage über das zoonotische Potential dieser Paramyxoviren sowie über ihre Verwandtschaft zu dem Nipah-Virus (NiV), einem zoonotischen Vertreter der Henipaviren, bzw. dem humanen Mumpsvirus (hMuV) zu machen. Diese Fragestellung ist von besonderem Interesse, da für NiV und hMuV bekannt ist, dass sie zu klinischen Infektionen in Menschen führen können und im Falle von NiV eine Übertragung von Flughunden auf den Menschen stattfand. Hinsichtlich des afrikanischen Henipavirus M74 konnte gezeigt werden, dass das rezeptorbindende Glykoprotein (G) in der Lage ist, mit dem zellulären Henipavirusrezeptor zu interagieren. Zudem weist die proteolytische Spaltung des Fusionsproteins (F) Ähnlichkeiten zu dem korrespondierenden Protein von NiV auf. Die Bildung von Riesenzellen, welche durch die Coexpression von den beiden Glykoproteinen F und G induziert wird und ein typischer zytopathogener Effekt von Paramyxoviren ist, war im Falle der beiden M74-Glykoproteinen auf Zelllinien von Fledertieren beschränkt. Weitere Versuche ergaben, dass insbesondere ein ineffizienter zellulärer Transport des G Proteins an die Zelloberfläche für die eingeschränkte funktionelle Aktivität verantwortlich ist. Die funktionelle Aktivität des Fusions- (F) und des Hämagglutinin-Neuraminidase- (HN) Glykoproteins des Fledertier-Mumpsvirus, wurde durch den Nachweis von Zell-zu-Zell Fusion in verschiedenen Säugetierzelllinien, einschließlich humanen Zellen, nachgewiesen. Zudem waren die batMuV Glykoproteine in der Lage mit humanen MuV-Glycoproteinen zu interagieren und die Bildung von Riesenzellen hervorzurufen. Die Expression von chimären F Proteinen zeigte, dass das Signalpeptid für die Größe der Riesenzellen, womit in diesem Fall die Anzahl der Zellkerne innerhalb einer Zytoplasmamembran gemeint ist, verantwortlich ist. Desweiteren wurde nachgewiesen, dass das batMuV HN Protein an Sialinsäuren bindet und hämadsorbierende Eigenschaften besitzt, während keine Neuraminidaseaktivität nachgewiesen werden konnte. In dieser Arbeit wurde gezeigt, dass beide fledertier-assoziierte Paramyxoviren funktionelle Ähnlichkeiten zu NiV bzw. hMuV aufweisen, sodass ein grundsätzliches zoonotisches Potential vorhanden ist. Solange allerdings nur Virussequenzen und keine Virusisolate verfügbar sind, können keine genauen Angaben über das tatsächliche Gefahrenpotential einer Infektion des Menschen bzw. einer Mensch-zu-Mensch-Übertragung gemacht werden. Durch die verwendeten in vitro-Techniken konnten jedoch bereits bedeutende Erkenntnisse über die Virus-Wirts-Interaktion der untersuchten fledertier-assoziierten Paramyxoviren gewonnen werden und damit bereits elementare Grundlagen für die Evaluierung ihres zoonotischen Potentials geleistet werden.
Language	English
Size	Online-Ressource (VIII, 154 S. = 18.551 kb, text), Ill., graph. Darst., Kt.
Publisher	Tierärztl. Hochsch
Publishing place	Hannover
Document type	Book ; Online ; Thesis
Thesis / German Habilitation thesis	Tierärztl. Hochsch., Inst. of Virology, Ph.D. Diss.--Hannover, 2014
Database	Former special subject collection: coastal and deep sea fishing

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Article: Discovery of Polyphenolic Natural Products as SARS-CoV-2 M

Krüger, Nadine / Kronenberger, Thales / Xie, Hang / Rocha, Cheila / Pöhlmann, Stefan / Su, Haixia / Xu, Yechun / Laufer, Stefan A / Pillaiyar, Thanigaimalai

Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)

2023 Volume 16, Issue 2

Abstract: The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has forced the development of direct-acting antiviral drugs due to the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. The main protease of SARS-CoV-2 is a crucial enzyme that breaks down ... ...

Abstract	The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has forced the development of direct-acting antiviral drugs due to the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic. The main protease of SARS-CoV-2 is a crucial enzyme that breaks down polyproteins synthesized from the viral RNA, making it a validated target for the development of SARS-CoV-2 therapeutics. New chemical phenotypes are frequently discovered in natural goods. In the current study, we used a fluorogenic assay to test a variety of natural products for their ability to inhibit SARS-CoV-2 M
Language	English
Publishing date	2023-01-28
Publishing country	Switzerland
Document type	Journal Article
ZDB-ID	2193542-7
ISSN	1424-8247
ISSN	1424-8247
DOI	10.3390/ph16020190
Database	MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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