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  1. Artikel ; Online: Transcriptomics of Leaf Development in the Endangered Dioecious

    Qin, Guole / Li, Xiaodong / Qin, Yingcan / Lu, Linyuan / Gao, Lixia / Guan, Delong

    Genes

    2024  Band 15, Heft 3

    Abstract: ... Magnolia ... ...

    Abstract Magnolia kwangsiensis
    Mesh-Begriff(e) Magnolia/genetics ; Gene Expression Profiling ; Transcriptome/genetics ; Plant Leaves/genetics ; Plant Leaves/chemistry ; Sequence Analysis, RNA
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2024-03-04
    Erscheinungsland Switzerland
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 2527218-4
    ISSN 2073-4425 ; 2073-4425
    ISSN (online) 2073-4425
    ISSN 2073-4425
    DOI 10.3390/genes15030335
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  2. Artikel ; Online: Population genomics analysis reveals footprints of selective breeding in a rapid-growth variety of Paulownia fortunei with apical dominance.

    Qin, Guo-Le / Fu, Chuan-Ming / Tang, Fan / Yin, Jian / Guan, De-Long / Shi, Chen-Yu

    Genomics

    2024  Band 116, Heft 3, Seite(n) 110849

    Abstract: Paulownia fortunei is an ecologically and economically valuable tree cultivated for its rapid growth and high-quality timber. To enhance Paulownia germplasm, we have developed the elite variety QingT with patented advantages in growth rate and apical ... ...

    Abstract Paulownia fortunei is an ecologically and economically valuable tree cultivated for its rapid growth and high-quality timber. To enhance Paulownia germplasm, we have developed the elite variety QingT with patented advantages in growth rate and apical dominance. To illuminate the genetic basis of QingT's superior traits, here we harness comparative population genomics to analyze genomic variation patterns between QingT and common Paulownia. We performed whole-genome re-sequencing of 30 QingT and 30 common samples, detecting 15.6 million SNPs and 2.6 million indels. Phylogeny and population structure analyses robustly partitioned common and QingT into distinct groups which indicate robust genome stabilization. QingT exhibited reduced heterozygosity and linkage disequilibrium decay compared to common Paulownia, reflecting high recombination, indicating hybridizing effects with common white-flowered string is the source of its patented advantages. Genome selection scans uncovered 25 regions of 169 genes with elevated nucleotide diversity, indicating selection sweeps among groups. Functional analysis of sweep genes revealed upregulation of ribosomal, biosynthesis, and growth pathways in QingT, implicating enhanced protein production and developmental processes in its rapid growth phenotype. This study's insights comprehensively chart genomic variation during Paulownia breeding, localizing candidate loci governing agronomic traits, and underpinnings of future molecular breeding efforts to boost productivity.
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2024-04-26
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 356334-0
    ISSN 1089-8646 ; 0888-7543
    ISSN (online) 1089-8646
    ISSN 0888-7543
    DOI 10.1016/j.ygeno.2024.110849
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  3. Artikel: Effects of microhabitat on rodent-mediated seed removal of endangered

    Wang, Guohai / Pan, Yang / Qin, Guole / Tan, Weining / Lu, Changhu

    PeerJ

    2020  Band 8, Seite(n) e10378

    Abstract: Seed removal behaviors of rodents are largely influenced by microhabitat. Although the karst ecosystem is composed of a broad variety of microhabitats, we have no information on how they affect such behaviors. We investigated rodents' seed removal ... ...

    Abstract Seed removal behaviors of rodents are largely influenced by microhabitat. Although the karst ecosystem is composed of a broad variety of microhabitats, we have no information on how they affect such behaviors. We investigated rodents' seed removal behaviors in four karst microhabitats (stone cavern, stone groove, stone surface, and soil surface) using three types of
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2020-11-16
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 2703241-3
    ISSN 2167-8359
    ISSN 2167-8359
    DOI 10.7717/peerj.10378
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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