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  1. Article ; Online: Insights into how environment shapes post-mortem RNA transcription in mouse brain

    Raphael Severino Bonadio / Larissa Barbosa Nunes / Patricia Natália S. Moretti / Juliana Forte Mazzeu / Stefano Cagnin / Aline Pic-Taylor / Silviene Fabiana de Oliveira

    Scientific Reports, Vol 11, Iss 1, Pp 1-

    2021  Volume 9

    Abstract: Abstract Most biological features that occur on the body after death were already deciphered by traditional medicine. However, the molecular mechanisms triggered in the cellular microenvironment are not fully comprehended yet. Previous studies reported ... ...

    Abstract Abstract Most biological features that occur on the body after death were already deciphered by traditional medicine. However, the molecular mechanisms triggered in the cellular microenvironment are not fully comprehended yet. Previous studies reported gene expression alterations in the post-mortem condition, but little is known about how the environment could influence RNA degradation and transcriptional regulation. In this work, we analysed the transcriptome of mouse brain after death under three concealment simulations (air exposed, buried, and submerged). Our analyses identified 2,103 genes differentially expressed in all tested groups 48 h after death. Moreover, we identified 111 commonly upregulated and 497 commonly downregulated genes in mice from the concealment simulations. The gene functions shared by the individuals from the tested environments were associated with RNA homeostasis, inflammation, developmental processes, cell communication, cell proliferation, and lipid metabolism. Regarding the altered biological processes, we identified that the macroautophagy process was enriched in the upregulated genes and lipid metabolism was enriched in the downregulated genes. On the other hand, we also described a list of biomarkers associated with the submerged and buried groups, indicating that these environments can influence the post-mortem RNA abundance in its particular way.
    Keywords Medicine ; R ; Science ; Q
    Subject code 612
    Language English
    Publishing date 2021-06-01T00:00:00Z
    Publisher Nature Portfolio
    Document type Article ; Online
    Database BASE - Bielefeld Academic Search Engine (life sciences selection)

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  2. Article ; Online: Análise genética de problemas craniofaciais

    Ricardo Machado Cruz / Silviene Fabiana de Oliveira

    Revista Dental Press de Ortodontia e Ortopedia Facial , Vol 12, Iss 5, Pp 141-

    revisão da literatura e diretrizes para investigações clínico-laboratoriais (parte 2) Genetic analysis of craniofacial problems: a review of the literature and some guidelines for clinical and laboratorial investigation (part 2)

    2007  Volume 150

    Abstract: OBJETIVO: esse artigo tem como objetivo ser uma fonte de informação acerca das técnicas e análises genéticas mais utilizadas em investigações clínicas e laboratoriais visando a identificação e a caracterização de genes relacionados a doenças ou ... ...

    Abstract OBJETIVO: esse artigo tem como objetivo ser uma fonte de informação acerca das técnicas e análises genéticas mais utilizadas em investigações clínicas e laboratoriais visando a identificação e a caracterização de genes relacionados a doenças ou distúrbios complexos, especialmente os que atingem as estruturas do crânio e da face. METODOLOGIA: são traçadas algumas diretrizes para guiar os futuros pesquisadores nos processos de seleção de amostras e obtenção de heredogramas para estudos genéticos e fornecidos conceitos e princípios gerais que norteiam métodos de análises genéticas. Tais métodos exigem conhecimento a respeito de transmissão gênica, genética molecular e utilização de marcadores moleculares, assim como envolvem o domínio de técnicas laboratoriais como, por exemplo, reações de polimerização em cadeia (PCR), eletroforese e seqüenciamento de DNA. RESULTADOS E CONCLUSÕES: as análises genéticas, em especial as análises de segregação e de ligação, representam importantes ferramentas à disposição dos pesquisadores na tentativa de relacionar fenótipos a genes específicos e na busca da exata localização cromossômica dos mesmos. Espera-se com esse artigo que os cirurgiões-dentistas clínicos possam começar a perceber a importância do assunto e buscar se aprofundar nessa área. AIM: The aim of this paper is to inform the reader about genetic techniques and analysis used in clinical and laboratorial investigations for the identification and characterization of the genetic determinants for complex disorders, especially those that attain craniofacial structures. METHODS: General concepts and principles of important methods of genetic analysis are given as well as some guidelines for future researchers, concerning sample gathering and pedigrees construction. These methods described here require knowledge about genetic transmission, molecular genetics and DNA markers, and involve the ability to deal with the current laboratorial techniques, including polymerase chain reactions, agarose or polyacrilamide gel and the use of DNA sequencers. RESULTS AND CONCLUSIONS: Those genetic analysis, mainly the segregation and the linkage analysis, are considered important tools in the attempt to make the relationship between some phenotypes and specific genotypes, and to search for the exact chromosomal localization of each one of these genes. The knowledge of these information can help clinical dentists to understand the important role played by genetics, leading them to get deeper into the subject.
    Keywords Heredogramas ; Análise de segregação ; Análise de ligação ; Más formações craniofaciais ; Pedigrees ; Segregation analysis ; Linkage analysis ; Craniofacial disorders ; Medicine ; R ; Dentistry ; RK1-715
    Language Portuguese
    Publishing date 2007-10-01T00:00:00Z
    Publisher Dental Press Editora
    Document type Article ; Online
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  3. Article ; Online: Análise genética de problemas craniofaciais

    Ricardo Machado Cruz / Silviene Fabiana de Oliveira

    Revista Dental Press de Ortodontia e Ortopedia Facial , Vol 12, Iss 5, Pp 133-

    revisão da literatura e diretrizes para investigações clínico-laboratoriais (parte 1) Genetic analysis of craniofacial problems: a review of the literature and some guidelines for clinical and laboratorial investigation (part 1)

    2007  Volume 140

    Abstract: INTRODUÇÃO: cada vez mais se descobre que os genes têm papel fundamental na etiologia dos problemas craniofaciais, no entanto, o conhecimento das bases da genética humana ainda está muito distante da prática diária do cirurgião-dentista clínico. OBJETIVO: ...

    Abstract INTRODUÇÃO: cada vez mais se descobre que os genes têm papel fundamental na etiologia dos problemas craniofaciais, no entanto, o conhecimento das bases da genética humana ainda está muito distante da prática diária do cirurgião-dentista clínico. OBJETIVO: o objetivo deste trabalho é ser uma fonte de consulta, provendo o leitor com conceitos e nomenclaturas pertinentes à área da genética humana. METODOLOGIA: os autores apresentam e revisam os principais tópicos relacionados à genética investigativa, sobretudo no que diz respeito às doenças ou distúrbios multifatoriais e complexos que alteram o processo normal de crescimento e desenvolvimento craniofacial. RESULTADOS E CONCLUSÕES: é essencial que esses profissionais se atualizem para poder acompanhar os progressos atuais e futuros, tanto na área clínica investigativa quanto na área das pesquisas moleculares laboratoriais. INTRODUCTION: New researches show the important role played by genes in the etiology of craniofacial problems. In spite of that, knowledge of the basis of Human Genetics is still very far from the daily practice of clinical dentists. AIM: The main aim of this paper is to serve as a valuable source of information on Genetics for readers, supplying them with the main concepts and nomenclature in this field. METHODS: The authors provide an overview of central concepts and topical issues in modern genetic investigation, with special attention to the complex and multifactorial disorders that disturb the normal process of craniofacial growth and development. RESULTS AND CONCLUSION: It is indispensable for updated clinical dentists to have at least a basic knowledge about the basis of Human Genetics in order to follow its current and future progresses in both areas: clinical investigative and Molecular Genetics.
    Keywords Genética humana ; Análises genéticas ; Crescimento e desenvolvimento craniofacial ; Human Genetics ; Genetic analysis ; Craniofacial growth and development ; Medicine ; R ; Dentistry ; RK1-715
    Language Portuguese
    Publishing date 2007-10-01T00:00:00Z
    Publisher Dental Press Editora
    Document type Article ; Online
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  4. Article ; Online: Avaliação da cobertura do programa de triagem neonatal de hemoglobinopatias em populações do Recôncavo Baiano, Brasil Evaluation of coverage by a neonatal screening program for hemoglobinopathies in the Recôncavo region of Bahia, Brazil

    Wellington dos Santos Silva / Angel Lastra / Silviene Fabiana de Oliveira / Nazaré Klautau-Guimarães / Cesar Kope Grisolia

    Cadernos de Saúde Pública, Vol 22, Iss 12, Pp 2561-

    2006  Volume 2566

    Abstract: Em 2001, a Portaria n. 822/2001 do Ministério da Saúde tornou obrigatória a triagem neonatal para as hemoglobinopatias, especialmente a anemia falciforme, a doença genética mais comum no Brasil. A Bahia, em decorrência de sua história de povoamento, é o ... ...

    Abstract Em 2001, a Portaria n. 822/2001 do Ministério da Saúde tornou obrigatória a triagem neonatal para as hemoglobinopatias, especialmente a anemia falciforme, a doença genética mais comum no Brasil. A Bahia, em decorrência de sua história de povoamento, é o Estado com maior prevalência dessa doença no país. No presente trabalho, apresentamos a cobertura da triagem neonatal (número de recém-nascidos/número de triagens realizadas) no período de 2001 a 2003 nos municípios de Cachoeira, São Félix e Maragogipe, localizados na região do Recôncavo Baiano, e a freqüência das hemoglobinas variantes HbS e HbC na população dos mesmos municípios, com exceção de São Félix. A freqüência total estimada de portadores para as duas hemoglobinas nessas populações foi de 13,0% e nos recém-nascidos de 8,5% em 2001, 6,5% em 2002 e 11,6% em 2003. A cobertura da triagem neonatal, quando se considera o período de 2001 a 2003, caiu de 82,6% para 46,4% no Município de Cachoeira, aumentou de 23,7% para 56,2% em Maragogipe e em São Félix atingiu 100%. Os dados aqui apresentados apontam para a necessidade de um melhor preparo dos serviços de saúde pública na maioria dos municípios analisados do Recôncavo Baiano para a cobertura da triagem neonatal. In 2001, government ruling n. MS 822/01 by the Brazilian Ministry of Health made neonatal screening mandatory for hemoglobinopathies, with special focus on sickle cell disease, the most common hemoglobinopathy in Brazil. Bahia is the State of Brazil with the highest prevalence of this disease. The current paper reports on the prevalence of hemoglobin variants HbS and HbC, which cause sickle cell disease, in the cities of Cachoeira, Maragogipe, and São Félix, Bahia State. The overall proportion of carriers for the two forms of hemoglobin was 13%. From 2001 to 2003, the neonatal screening rate decreased from 82.6% to 46.4% in Cachoeira and increased from 37.0% to 56.2% in Maragogipe. Thus, only about one-half of children are being tested in these cities. The findings show that the public health care ...
    Keywords Hemoglobinopatias ; Triagem Neonatal ; Anemia Falciforme ; Hemoglobinopathies ; Neonatal Screening ; Sickle Cell Anemia ; Medicine ; R ; Public aspects of medicine ; RA1-1270
    Language English
    Publishing date 2006-12-01T00:00:00Z
    Publisher Escola Nacional de Saúde Pública, Fundação Oswaldo Cruz
    Document type Article ; Online
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