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  1. Buch: Biodiversität zwischen Wasser und Land

    Altermatt, Florian / Güsewell, Sabine / Holderegger, Rolf

    Exkursionen zu Gewässern, Mooren und Auen der Schweiz

    2024  

    Verfasserangabe Florian Altermatt, Sabine Güsewell, Rolf Holderegger
    Thema/Rubrik (Code) 580
    Sprache Deutsch
    Umfang 350 Seiten, Illustrationen, Diagramme, Karten, 22.5 cm x 15.5 cm
    Ausgabenhinweis 1. Auflage 2024
    Verlag Haupt Verlag
    Erscheinungsort Bern
    Erscheinungsland Schweiz
    Dokumenttyp Buch
    HBZ-ID HT030740750
    ISBN 978-3-258-08368-1 ; 3-258-08368-1
    Datenquelle Katalog ZB MED Ernährung, Umwelt, Agrar

    Zusatzmaterialien

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    Verfügbar in ZB MED Bonn

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    248/72 ausleihbar (Lesesaal) Freihandmagazin (U1)

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  2. Buch: Biodiversität zwischen Wasser und Land

    Altermatt, Florian / Güsewell, Sabine / Holderegger, Rolf

    Exkursionen zu Gewässern, Mooren und Auen der Schweiz

    2024  

    Abstract: Aquatische und terrestrische Lebensräume sind eng miteinander verknüpft. Zahlreiche Pflanzen- und Tierarten nutzen während ihres Lebens beide Lebensräume: zwischen «Wasser» und «Land» herrscht ein reger Austausch von Stoffen und Organismen. Auch die ... ...

    Verfasserangabe Rolf Holderegger ist Biologe und forscht zur terrestrischen Biodiversität und Naturschutzbiologie an der WSL Eidgenössische Forschungsanstalt in Birmensdorf bei Zürich. Ein besonderes Anliegen ist ihm die Umsetzung von Forschungsresultaten in die Praxis. Er lehrt an der ETH in Zürich
    Abstract Aquatische und terrestrische Lebensräume sind eng miteinander verknüpft. Zahlreiche Pflanzen- und Tierarten nutzen während ihres Lebens beide Lebensräume: zwischen «Wasser» und «Land» herrscht ein reger Austausch von Stoffen und Organismen. Auch die menschliche Nutzung und Gestaltung der Landschaft wird vom Wechselspiel zwischen aquatischen und terrestrischen Lebensräumen geprägt. -- Dieses Buch lädt dazu ein, auf acht Exkursionen die Funktionsweise dieser Lebensräume und ihre Biodiversität ...
    Schlagwörter Artenvielfalt ; Feuchtgebiete ; Flora und Fauna am Wasser ; Flüsse und Seen ; Naturführer ; Naturführer Schweiz ; Tiere und Pflanzen am Wasser ; Umwelt/Ökologie ; Natur- und Wanderführer
    Sprache Deutsch
    Umfang 350 p.
    Ausgabenhinweis 1
    Verlag Haupt Verlag
    Dokumenttyp Buch
    Anmerkung Ernährungs-, Umwelt- und Agrarwissenschaften 250418
    Format 166 x 234 x 24
    ISBN 9783258083681 ; 3258083681
    Datenquelle PDA

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  3. Buch: Hotspot Furka

    Hiltbrunner, Erika / Körner, Christian / Altermatt, Florian

    biologische Vielfalt im Gebirge

    2018  

    Verfasserangabe [Herausgeber] Erika Hiltbrunner und Christian Körner ; mit Beiträgen von Florian Altermatt [und vielen weiteren]
    Sprache Deutsch
    Umfang 60 Seiten, Illustrationen, Diagramme, Karten
    Verlag Alpine Forschungs- und Ausbildungsstation Furka (ALPFOR)
    Erscheinungsort Basel
    Erscheinungsland Schweiz
    Dokumenttyp Buch
    HBZ-ID HT019774293
    ISBN 978-3-033-06701-1 ; 3-033-06701-8
    Datenquelle Katalog ZB MED Ernährung, Umwelt, Agrar

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    Verfügbar in ZB MED Bonn

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    184/117 ausleihbar (Lesesaal) Freihandmagazin (U1)

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  4. Artikel ; Online: Invasive species drive cross-ecosystem effects worldwide.

    Peller, Tianna / Altermatt, Florian

    Nature ecology & evolution

    2024  

    Abstract: Invasive species are pervasive around the world and have profound impacts on the ecosystem they invade. Invasive species, however, can also have impacts beyond the ecosystem they invade by altering the flow of non-living materials (for example, nutrients ...

    Abstract Invasive species are pervasive around the world and have profound impacts on the ecosystem they invade. Invasive species, however, can also have impacts beyond the ecosystem they invade by altering the flow of non-living materials (for example, nutrients or chemicals) or movement of organisms across the boundaries of the invaded ecosystem. Cross-ecosystem interactions via spatial flows are ubiquitous in nature, for example, connecting forests and lakes, grasslands and rivers, and coral reefs and the deep ocean. Yet, we have a limited understanding of the cross-ecosystem impacts invasive species have relative to their local effects. By synthesizing emerging evidence, here we demonstrate the cross-ecosystem impacts of invasive species as a ubiquitous phenomenon that influences biodiversity and ecosystem functioning around the world. We identify three primary ways by which invasive species have cross-ecosystem effects: first, by altering the magnitude of spatial flows across ecosystem boundaries; second, by altering the quality of spatial flows; and third, by introducing novel spatial flows. Ultimately, the strong impacts invasive species can drive across ecosystem boundaries suggests the need for a paradigm shift in how we study and manage invasive species around the world, expanding from a local to a cross-ecosystem perspective.
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2024-03-19
    Erscheinungsland England
    Dokumenttyp Journal Article ; Review
    ISSN 2397-334X
    ISSN (online) 2397-334X
    DOI 10.1038/s41559-024-02380-1
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  5. Artikel: Editorial. Environmental threats we can act upon. How to use the science-policy dialogue

    Altermatt, Florian

    Gaia

    2021  Band 30, Heft 3, Seite(n) 137

    Sprache Deutsch ; Englisch
    Dokumenttyp Artikel
    ZDB-ID 1114994-2
    ISSN 0940-5550
    Datenquelle Current Contents Ernährung, Umwelt, Agrar

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    Z 7434: Hefte anzeigen

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  6. Artikel ; Online: Spatiotemporal dynamics in freshwater amphipod assemblages are associated with surrounding terrestrial land use type

    Cereghetti, Eva / Altermatt, Florian

    Ecosphere. 2023 Mar., v. 14, no. 3 p.e4469-

    2023  

    Abstract: Biological assemblages are the result of dynamic processes that have explicit temporal and spatial dimensions. Although biodiversity patterns can be directly inferred from the structure of these assemblages, an assessment of changes through time and ... ...

    Abstract Biological assemblages are the result of dynamic processes that have explicit temporal and spatial dimensions. Although biodiversity patterns can be directly inferred from the structure of these assemblages, an assessment of changes through time and space is needed to understand how organisms initially assembled and how they are responding to local environmental and biotic factors. Small freshwater streams are particularly affected by contemporary anthropogenic activities and biological invasions, yet they are commonly less studied, as studies often focus on lakes and large streams. Here, we conducted a spatially explicit analysis of keystone shredder assemblages across eight years in 12 replicated small tributary streams. In each stream, we monitored multiple sites per kilometer of stream length. By assessing temporal beta diversity dynamics, defined by the gain or loss of species or abundance per species at individual sites, we show that changes in amphipod assemblages occur within the context of the surrounding terrestrial matrix and reflect recent amphipod colonization history. While amphipod composition was mostly constant in streams located in forested catchments, streams embedded in catchments with more extensive agricultural land use displayed more pronounced temporal changes, either driven by colonization of unoccupied upstream locations or by more pronounced but undirected fluctuations in gains and losses of species or abundance per species. Our study thus suggests that agricultural landscapes might destabilize aquatic amphipod assemblages, causing higher temporal changes in community structures and highlighting the vulnerability of aquatic ecosystems to terrestrial land use drivers.
    Schlagwörter Amphipoda ; agricultural land ; freshwater ; land use ; species diversity ; streams
    Sprache Englisch
    Erscheinungsverlauf 2023-03
    Erscheinungsort John Wiley & Sons, Inc.
    Dokumenttyp Artikel ; Online
    Anmerkung JOURNAL ARTICLE
    ZDB-ID 2572257-8
    ISSN 2150-8925
    ISSN 2150-8925
    DOI 10.1002/ecs2.4469
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

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  7. Artikel ; Online: Management of DNA reference libraries for barcoding and metabarcoding studies with the R package refdb

    Keck, François / Altermatt, Florian

    Molecular Ecology Resources. 2023 Feb., v. 23, no. 2 p.511-518

    2023  

    Abstract: DNA barcoding and metabarcoding are revolutionizing the study and survey of biodiversity. In order to assign taxonomic labels to the DNA sequence data retrieved, these methods are strongly dependent on comprehensive and accurate reference databases. ... ...

    Abstract DNA barcoding and metabarcoding are revolutionizing the study and survey of biodiversity. In order to assign taxonomic labels to the DNA sequence data retrieved, these methods are strongly dependent on comprehensive and accurate reference databases. Producing reliable databases linking biological sequences and taxonomic data can be—and often has been—done using mainstream tools such as spreadsheet software. However, spreadsheets quickly become insufficient when the amount of data increases to thousands of taxa and sequences to be matched, and validation operations become more complex and are error prone if done in a manual way. Thus, there is a clear need for providing scientists with user‐friendly, reliable and powerful tools to manipulate and manage DNA reference databases in tractable, sound and efficient ways. Here, we introduce the R package refdb as an environment for semi‐automatic and assisted construction of DNA reference libraries. The refdb package is a reference database manager offering a set of powerful functions to import, organize, clean, filter, audit and export the data. It is broadly applicable in metabarcoding data generally obtained in biodiversity and biomonitoring studies. We present the main features of the package and outline how refdb can speed up reference database generation, management and handling, and thus contribute to standardization and repeatability in barcoding and metabarcoding studies.
    Schlagwörter DNA ; DNA barcoding ; biodiversity ; computer software ; databases ; environmental monitoring ; imports ; nucleotide sequences ; surveys
    Sprache Englisch
    Erscheinungsverlauf 2023-02
    Umfang p. 511-518.
    Erscheinungsort John Wiley & Sons, Ltd
    Dokumenttyp Artikel ; Online
    Anmerkung JOURNAL ARTICLE
    ZDB-ID 2406816-0
    ISSN 1471-8286 ; 1755-098X
    ISSN (online) 1471-8286
    ISSN 1755-098X
    DOI 10.1111/1755-0998.13723
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

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    Z 2005/725: Hefte anzeigen

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  8. Artikel ; Online: Management of DNA reference libraries for barcoding and metabarcoding studies with the R package refdb.

    Keck, François / Altermatt, Florian

    Molecular ecology resources

    2022  

    Abstract: DNA barcoding and metabarcoding are revolutionizing the study and survey of biodiversity. In order to assign taxonomic labels to the DNA sequence data retrieved, these methods are strongly dependent on comprehensive and accurate reference databases. ... ...

    Abstract DNA barcoding and metabarcoding are revolutionizing the study and survey of biodiversity. In order to assign taxonomic labels to the DNA sequence data retrieved, these methods are strongly dependent on comprehensive and accurate reference databases. Producing reliable databases linking biological sequences and taxonomic data can be-and often has been-done using mainstream tools such as spreadsheet software. However, spreadsheets quickly become insufficient when the amount of data increases to thousands of taxa and sequences to be matched, and validation operations become more complex and are error prone if done in a manual way. Thus, there is a clear need for providing scientists with user-friendly, reliable and powerful tools to manipulate and manage DNA reference databases in tractable, sound and efficient ways. Here, we introduce the R package refdb as an environment for semi-automatic and assisted construction of DNA reference libraries. The refdb package is a reference database manager offering a set of powerful functions to import, organize, clean, filter, audit and export the data. It is broadly applicable in metabarcoding data generally obtained in biodiversity and biomonitoring studies. We present the main features of the package and outline how refdb can speed up reference database generation, management and handling, and thus contribute to standardization and repeatability in barcoding and metabarcoding studies.
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2022-10-14
    Erscheinungsland England
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 2406833-0
    ISSN 1755-0998 ; 1755-098X
    ISSN (online) 1755-0998
    ISSN 1755-098X
    DOI 10.1111/1755-0998.13723
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  9. Artikel ; Online: Measuring the state of aquatic environments using eDNA-upscaling spatial resolution of biotic indices.

    Blackman, Rosetta C / Carraro, Luca / Keck, François / Altermatt, Florian

    Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences

    2024  Band 379, Heft 1904, Seite(n) 20230121

    Abstract: Aquatic macroinvertebrates, including many aquatic insect orders, are a diverse and ecologically relevant organismal group yet they are strongly affected by anthropogenic activities. As many of these taxa are highly sensitive to environmental change, ... ...

    Abstract Aquatic macroinvertebrates, including many aquatic insect orders, are a diverse and ecologically relevant organismal group yet they are strongly affected by anthropogenic activities. As many of these taxa are highly sensitive to environmental change, they offer a particularly good early warning system for human-induced change, thus leading to their intense monitoring. In aquatic ecosystems there is a plethora of biotic monitoring or biomonitoring approaches, with more than 300 assessment methods reported for freshwater taxa alone. Ultimately, monitoring of aquatic macroinvertebrates is used to calculate ecological indices describing the state of aquatic systems. Many of the methods and indices used are not only hard to compare, but especially difficult to scale in time and space. Novel DNA-based approaches to measure the state and change of aquatic environments now offer unprecedented opportunities, also for possible integration towards commonly applicable indices. Here, we first give a perspective on DNA-based approaches in the monitoring of aquatic organisms, with a focus on aquatic insects, and how to move beyond traditional point-based biotic indices. Second, we demonstrate a proof-of-concept for spatially upscaling ecological indices based on environmental DNA, demonstrating how integration of these novel molecular approaches with hydrological models allows an accurate evaluation at the catchment scale. This article is part of the theme issue 'Towards a toolkit for global insect biodiversity monitoring'.
    Mesh-Begriff(e) Animals ; Aquatic Organisms/genetics ; Biodiversity ; Biological Monitoring/methods ; DNA, Environmental/analysis ; Ecosystem ; Environmental Monitoring/methods ; Insecta/genetics
    Chemische Substanzen DNA, Environmental
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2024-05-06
    Erscheinungsland England
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't
    ZDB-ID 208382-6
    ISSN 1471-2970 ; 0080-4622 ; 0264-3839 ; 0962-8436
    ISSN (online) 1471-2970
    ISSN 0080-4622 ; 0264-3839 ; 0962-8436
    DOI 10.1098/rstb.2023.0121
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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    Verfügbar in ZB MED Köln/Königswinter

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  10. Artikel ; Online: Context‐dependent evolution of high trophic position drives functional disparity in subterranean crustaceans

    Premate, Ester / Borko, Špela / Altermatt, Florian / Fišer, Cene

    Functional Ecology. 2023 Sept., v. 37, no. 9 p.2523-2534

    2023  

    Abstract: Species performance depends on the concerted interplay of their functional traits. Natural selection acts on the performance of the species and influences entire suits of interdependent functional traits, thereby driving the evolution of functional ... ...

    Abstract Species performance depends on the concerted interplay of their functional traits. Natural selection acts on the performance of the species and influences entire suits of interdependent functional traits, thereby driving the evolution of functional diversity (FD) within a clade. In a given habitat, interdependent functional traits are expected to integrate into only a few adaptive combinations. When a clade diversifies in different habitats, the FD within habitats (herein called α‐FD) diversifies in response to local selections, while between the habitats, alternative adaptive combinations of interdependent traits that are specific to the habitat emerge. This multivariate selection leads to two hypotheses. First, realized α‐FD within one habitat represents only a small fraction of the variation of functional traits, and second, realized FDs across habitats (hereafter called β‐FD) are equal to or greater than would be in the absence of the interdependence of functional traits. We tested these hypotheses using 185 species of the highly diverse subterranean amphipod genus Niphargus living in three habitats: river interstitial, cave lakes, and cave streams. We (i) explored integration of functional traits related to locomotion and feeding biology and tested (ii) if realized α‐FD within each habitat is lower than it would be without trait interdependence, and (iii) if realized β‐FD in pairwise comparisons of habitats is higher than it would be without trait interdependence. In all three habitats, the length of the appendages as a proxy of the locomotion speed was positively correlated with the trophic position of the species. On the contrary, the body shape correlations were habitat dependent: species in high trophic positions were slender, stout or invariant in shape in interstitial, cave streams and cave lakes, respectively. Using null models, we show that only a fraction of functional trait combinations was realized in each habitat, whereas β‐FD between habitats was equal to or greater than the null expectations. The results indicate preserved potential for diversification in species within and between habitats. This potential can be realized through hybridization and can drive diversification in adaptive radiations. Moreover, this perspective on the evolution of FD is compatible with several central ecological and evolutionary concepts, such as adaptive landscape or ecological niche theory. Read the free Plain Language Summary for this article on the Journal blog.
    Schlagwörter Amphipoda ; functional diversity ; hybridization ; locomotion ; natural selection ; niches ; rivers
    Sprache Englisch
    Erscheinungsverlauf 2023-09
    Umfang p. 2523-2534.
    Erscheinungsort John Wiley & Sons, Ltd
    Dokumenttyp Artikel ; Online
    Anmerkung JOURNAL ARTICLE
    ZDB-ID 2020307-X
    ISSN 1365-2435 ; 0269-8463
    ISSN (online) 1365-2435
    ISSN 0269-8463
    DOI 10.1111/1365-2435.14407
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

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