LIVIVO - Das Suchportal für Lebenswissenschaften

switch to English language
Erweiterte Suche

Suchergebnis

Treffer 1 - 9 von insgesamt 9

Suchoptionen

  1. Artikel ; Online: Targeting Mammalian Translational Inhibition with Tetracyclines.

    Boer, Robert E / Schneekloth, John S

    Cell chemical biology

    2018  Band 25, Heft 12, Seite(n) 1437–1438

    Abstract: In this issue of Cell Chemical Biology, Mortison et al. (2018) report an in-depth mechanistic study of targets of two different tetracyclines in mammalian cells. Unbiased chemoproteomics and RNA sequence mapping help identify specific ribosomal ... ...

    Abstract In this issue of Cell Chemical Biology, Mortison et al. (2018) report an in-depth mechanistic study of targets of two different tetracyclines in mammalian cells. Unbiased chemoproteomics and RNA sequence mapping help identify specific ribosomal substructures bound by tetracyclines, providing insight into the therapeutic potential for tetracyclines in many diseases.
    Mesh-Begriff(e) Animals ; Anti-Bacterial Agents ; Humans ; Ribosomes ; Tetracyclines
    Chemische Substanzen Anti-Bacterial Agents ; Tetracyclines
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2018-12-21
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, N.I.H., Intramural ; Comment
    ISSN 2451-9448
    ISSN (online) 2451-9448
    DOI 10.1016/j.chembiol.2018.12.006
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Volltext online

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

    Fernleihe an ZB MED

    Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.

  2. Artikel ; Online: Chemical Modulation of Pre-mRNA Splicing in Mammalian Systems.

    Boer, Robert E / Torrey, Zachary R / Schneekloth, John S

    ACS chemical biology

    2020  Band 15, Heft 4, Seite(n) 808–818

    Abstract: RNA splicing is a key component of gene expression and proteomic diversity in humans. The spliceosome assembles on and processes individual nascent pre-mRNA transcripts into distinct mature mRNAs that can code for different proteins. Splicing programs ... ...

    Abstract RNA splicing is a key component of gene expression and proteomic diversity in humans. The spliceosome assembles on and processes individual nascent pre-mRNA transcripts into distinct mature mRNAs that can code for different proteins. Splicing programs can be affected by somatic mutations and changes in response to exogenous stimuli. Importantly, alterations in splicing can be direct drivers of diseases including cancers. This Review describes recent advances and the potential for targeting and controlling pre-mRNA splicing in humans with small molecules, ranging from targeting spliceosomal proteins to direct targeting of individual RNA transcripts.
    Mesh-Begriff(e) G-Quadruplexes/drug effects ; Humans ; Protein Kinase Inhibitors/pharmacology ; RNA Precursors/drug effects ; RNA Precursors/metabolism ; RNA Splicing/drug effects ; Serine-Arginine Splicing Factors/metabolism ; Spliceosomes/drug effects
    Chemische Substanzen Protein Kinase Inhibitors ; RNA Precursors ; Serine-Arginine Splicing Factors (170974-22-8)
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2020-04-07
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Intramural ; Review
    ISSN 1554-8937
    ISSN (online) 1554-8937
    DOI 10.1021/acschembio.0c00001
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

    Fernleihe an ZB MED

    Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.

  3. Artikel ; Online: The 5-lipoxygenase/cyclooxygenase-2 cross-over metabolite, hemiketal E

    Nakashima, Fumie / Giménez-Bastida, Juan A / Luis, Paula B / Presley, Sai H / Boer, Robert E / Chiusa, Manuel / Shibata, Takahiro / Sulikowski, Gary A / Pozzi, Ambra / Schneider, Claus

    The Journal of biological chemistry

    2023  Band 299, Heft 4, Seite(n) 103050

    Abstract: Consecutive oxygenation of arachidonic acid by 5-lipoxygenase and cyclooxygenase-2 yields the hemiketal eicosanoids, ... ...

    Abstract Consecutive oxygenation of arachidonic acid by 5-lipoxygenase and cyclooxygenase-2 yields the hemiketal eicosanoids, HKE
    Mesh-Begriff(e) Mice ; Humans ; Animals ; Cyclooxygenase 2/metabolism ; Arachidonic Acid ; Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2/metabolism ; Arachidonate 5-Lipoxygenase ; Vascular Endothelial Growth Factor A/metabolism ; Neovascularization, Physiologic ; Human Umbilical Vein Endothelial Cells/metabolism ; Angiogenesis Inhibitors/pharmacology ; Cell Movement ; Cell Proliferation
    Chemische Substanzen Cyclooxygenase 2 (EC 1.14.99.1) ; Arachidonic Acid (27YG812J1I) ; Vascular Endothelial Growth Factor Receptor-2 (EC 2.7.10.1) ; Arachidonate 5-Lipoxygenase (EC 1.13.11.34) ; Vascular Endothelial Growth Factor A ; Angiogenesis Inhibitors
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2023-02-21
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural
    ZDB-ID 2997-x
    ISSN 1083-351X ; 0021-9258
    ISSN (online) 1083-351X
    ISSN 0021-9258
    DOI 10.1016/j.jbc.2023.103050
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Verfügbar in ZB MED Köln/Königswinter

    Uc I Zs.108: Hefte anzeigen Standort:
    Je nach Verfügbarkeit (siehe Angabe bei Bestand)
    bis Jg. 2021: Bestellungen von Artikeln über das Online-Bestellformular
    ab Jg. 2022: Lesesaal (EG)

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

  4. Artikel: Total Synthesis and Biological Activity of the Arachidonic Acid Metabolite Hemiketal E2

    Boer, Robert E / Giménez-Bastida, Juan Antonio / Boutaud, Olivier / Jana, Somnath / Schneider, Claus / Sulikowski, Gary A

    Organic letters. 2018 June 19, v. 20, no. 13

    2018  

    Abstract: The total synthesis of hemiketal E2 (HKE2) has been accomplished using a gold(I)-mediated cycloisomerization followed by oxidation of the enol ether product to introduce a unique keto-hemiketal, the core structure of HKE2. Synthetic hemiketal E2 ... ...

    Abstract The total synthesis of hemiketal E2 (HKE2) has been accomplished using a gold(I)-mediated cycloisomerization followed by oxidation of the enol ether product to introduce a unique keto-hemiketal, the core structure of HKE2. Synthetic hemiketal E2 reproduced biosynthetically derived HKE2 in the inhibition of human platelet aggregation.
    Schlagwörter arachidonic acid ; bioactive properties ; chemical structure ; enol ethers ; gold ; metabolites ; oxidation ; platelet aggregation
    Sprache Englisch
    Erscheinungsverlauf 2018-0619
    Umfang p. 4020-4022.
    Erscheinungsort American Chemical Society
    Dokumenttyp Artikel
    ISSN 1523-7052
    DOI 10.1021/acs.orglett.8b01578
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

    Fernleihe an ZB MED

    Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.

  5. Artikel ; Online: Discovery of Inhibitors of MicroRNA-21 Processing Using Small Molecule Microarrays.

    Connelly, Colleen M / Boer, Robert E / Moon, Michelle H / Gareiss, Peter / Schneekloth, John S

    ACS chemical biology

    2016  Band 12, Heft 2, Seite(n) 435–443

    Abstract: The identification of small molecules that bind to and perturb the function of microRNAs is an attractive approach for the treatment for microRNA-associated pathologies. However, there are only a few small molecules known to interact directly with ... ...

    Abstract The identification of small molecules that bind to and perturb the function of microRNAs is an attractive approach for the treatment for microRNA-associated pathologies. However, there are only a few small molecules known to interact directly with microRNAs. Here, we report the use of a small molecule microarray (SMM) screening approach to identify low molecular weight compounds that directly bind to a pre-miR-21 hairpin. Compounds identified using this approach exhibit good affinity for the RNA (ranging from 0.8-2.0 μM) and are not composed of a polycationic scaffold. Several of the highest affinity compounds inhibit Dicer-mediated processing, while in-line probing experiments indicate that the compounds bind to the apical loop of the hairpin, proximal to the Dicer site. This work provides evidence that small molecules can be developed to bind directly to and inhibit miR-21.
    Mesh-Begriff(e) Humans ; MicroRNAs/antagonists & inhibitors ; Small Molecule Libraries ; Structure-Activity Relationship
    Chemische Substanzen MIRN21 microRNA, human ; MicroRNAs ; Small Molecule Libraries
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2016-12-23
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Validation Study
    ISSN 1554-8937
    ISSN (online) 1554-8937
    DOI 10.1021/acschembio.6b00945
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

    Fernleihe an ZB MED

    Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.

  6. Artikel ; Online: Total Synthesis and Biological Activity of the Arachidonic Acid Metabolite Hemiketal E

    Boer, Robert E / Giménez-Bastida, Juan Antonio / Boutaud, Olivier / Jana, Somnath / Schneider, Claus / Sulikowski, Gary A

    Organic letters

    2018  Band 20, Heft 13, Seite(n) 4020–4022

    Abstract: The total synthesis of hemiketal ... ...

    Abstract The total synthesis of hemiketal E
    Mesh-Begriff(e) Arachidonic Acid/chemistry ; Blood Platelets ; Humans ; Molecular Structure ; Oxidation-Reduction
    Chemische Substanzen Arachidonic Acid (27YG812J1I)
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2018-06-19
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, Non-U.S. Gov't
    ISSN 1523-7052
    ISSN (online) 1523-7052
    DOI 10.1021/acs.orglett.8b01578
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

    Fernleihe an ZB MED

    Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.

  7. Artikel ; Online: Custom DNA Microarrays Reveal Diverse Binding Preferences of Proteins and Small Molecules to Thousands of G-Quadruplexes.

    Ray, Sreejana / Tillo, Desiree / Boer, Robert E / Assad, Nima / Barshai, Mira / Wu, Guanhui / Orenstein, Yaron / Yang, Danzhou / Schneekloth, John S / Vinson, Charles

    ACS chemical biology

    2020  Band 15, Heft 4, Seite(n) 925–935

    Abstract: Single-stranded DNA (ssDNA) containing four guanine repeats can form G-quadruplex (G4) structures. While cellular proteins and small molecules can bind G4s, it has been difficult to broadly assess their DNA-binding specificity. Here, we use custom DNA ... ...

    Abstract Single-stranded DNA (ssDNA) containing four guanine repeats can form G-quadruplex (G4) structures. While cellular proteins and small molecules can bind G4s, it has been difficult to broadly assess their DNA-binding specificity. Here, we use custom DNA microarrays to examine the binding specificities of proteins, small molecules, and antibodies across ∼15,000 potential G4 structures. Molecules used include fluorescently labeled pyridostatin (Cy5-PDS, a small molecule), BG4 (Cy5-BG4, a G4-specific antibody), and eight proteins (GST-tagged nucleolin, IGF2, CNBP, FANCJ, PIF1, BLM, DHX36, and WRN). Cy5-PDS and Cy5-BG4 selectively bind sequences known to form G4s, confirming their formation on the microarrays. Cy5-PDS binding decreased when G4 formation was inhibited using lithium or when ssDNA features on the microarray were made double-stranded. Similar conditions inhibited the binding of all other molecules except for CNBP and PIF1. We report that proteins have different G4-binding preferences suggesting unique cellular functions. Finally, competition experiments are used to assess the binding specificity of an unlabeled small molecule, revealing the structural features in the G4 required to achieve selectivity. These data demonstrate that the microarray platform can be used to assess the binding preferences of molecules to G4s on a broad scale, helping to understand the properties that govern molecular recognition.
    Mesh-Begriff(e) DNA, Single-Stranded/genetics ; DNA, Single-Stranded/metabolism ; DNA-Binding Proteins/metabolism ; G-Quadruplexes ; Humans ; Oligonucleotide Array Sequence Analysis ; Polymorphism, Single Nucleotide ; Protein Binding
    Chemische Substanzen DNA, Single-Stranded ; DNA-Binding Proteins
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2020-04-07
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Intramural
    ISSN 1554-8937
    ISSN (online) 1554-8937
    DOI 10.1021/acschembio.9b00934
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

    Fernleihe an ZB MED

    Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.

  8. Artikel ; Online: Synthetic ligands for PreQ

    Connelly, Colleen M / Numata, Tomoyuki / Boer, Robert E / Moon, Michelle H / Sinniah, Ranu S / Barchi, Joseph J / Ferré-D'Amaré, Adrian R / Schneekloth, John S

    Nature communications

    2019  Band 10, Heft 1, Seite(n) 1501

    Abstract: Riboswitches are naturally occurring RNA aptamers that regulate gene expression by binding to specific small molecules. Riboswitches control the expression of essential bacterial genes and are important models for RNA-small molecule recognition. Here, we ...

    Abstract Riboswitches are naturally occurring RNA aptamers that regulate gene expression by binding to specific small molecules. Riboswitches control the expression of essential bacterial genes and are important models for RNA-small molecule recognition. Here, we report the discovery of a class of synthetic small molecules that bind to PreQ
    Mesh-Begriff(e) Aptamers, Nucleotide/chemistry ; Aptamers, Nucleotide/genetics ; Aptamers, Nucleotide/metabolism ; Crystallography, X-Ray ; Ligands ; Nucleic Acid Conformation ; Pyrimidinones/chemical synthesis ; Pyrimidinones/chemistry ; Pyrimidinones/metabolism ; Pyrroles/chemical synthesis ; Pyrroles/chemistry ; Pyrroles/metabolism ; RNA Folding ; Riboswitch
    Chemische Substanzen 7-(aminomethyl)-7-deazaguanine ; Aptamers, Nucleotide ; Ligands ; Pyrimidinones ; Pyrroles ; Riboswitch
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2019-04-02
    Erscheinungsland England
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Extramural ; Research Support, N.I.H., Intramural ; Research Support, Non-U.S. Gov't
    ZDB-ID 2553671-0
    ISSN 2041-1723 ; 2041-1723
    ISSN (online) 2041-1723
    ISSN 2041-1723
    DOI 10.1038/s41467-019-09493-3
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

  9. Artikel ; Online: HNRNPH1-dependent splicing of a fusion oncogene reveals a targetable RNA G-quadruplex interaction.

    Neckles, Carla / Boer, Robert E / Aboreden, Nicholas / Cross, Allison M / Walker, Robert L / Kim, Bong-Hyun / Kim, Suntae / Schneekloth, John S / Caplen, Natasha J

    RNA (New York, N.Y.)

    2019  Band 25, Heft 12, Seite(n) 1731–1750

    Abstract: The primary oncogenic event in ∼85% of Ewing sarcomas is a chromosomal translocation that generates a fusion oncogene encoding an aberrant transcription factor. The exact genomic breakpoints within the translocated genes, ...

    Abstract The primary oncogenic event in ∼85% of Ewing sarcomas is a chromosomal translocation that generates a fusion oncogene encoding an aberrant transcription factor. The exact genomic breakpoints within the translocated genes,
    Mesh-Begriff(e) G-Quadruplexes ; Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoproteins/metabolism ; Oncogene Proteins, Fusion/genetics ; Oncogene Proteins, Fusion/metabolism ; Protein Binding ; RNA Splicing ; RNA, Messenger/chemistry ; RNA, Messenger/genetics ; RNA, Messenger/metabolism ; RNA-Binding Proteins
    Chemische Substanzen Heterogeneous-Nuclear Ribonucleoproteins ; Oncogene Proteins, Fusion ; RNA, Messenger ; RNA-Binding Proteins
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2019-09-11
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, N.I.H., Intramural
    ZDB-ID 1241540-6
    ISSN 1469-9001 ; 1355-8382
    ISSN (online) 1469-9001
    ISSN 1355-8382
    DOI 10.1261/rna.072454.119
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

    Zusatzmaterialien

    Kategorien

    Verfügbar in ZB MED Köln/Königswinter

    Zs.A 4777: Hefte anzeigen Standort:
    Je nach Verfügbarkeit (siehe Angabe bei Bestand)
    bis Jg. 1994: Bestellungen von Artikeln über das Online-Bestellformular
    Jg. 1995 - 2021: Lesesall (2.OG)
    ab Jg. 2022: Lesesaal (EG)

    Über subito bestellen

    Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.

Zum Seitenanfang