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  1. Artikel ; Online: Exploring the Protein Sequence Space with Global Generative Models.

    Romero-Romero, Sergio / Lindner, Sebastian / Ferruz, Noelia

    Cold Spring Harbor perspectives in biology

    2023  Band 15, Heft 11

    Abstract: Recent advancements in specialized large-scale architectures for training images and language have profoundly impacted the field of computer vision and natural language processing (NLP). Language models, such as the recent ChatGPT and GPT-4, have ... ...

    Abstract Recent advancements in specialized large-scale architectures for training images and language have profoundly impacted the field of computer vision and natural language processing (NLP). Language models, such as the recent ChatGPT and GPT-4, have demonstrated exceptional capabilities in processing, translating, and generating human language. These breakthroughs have also been reflected in protein research, leading to the rapid development of numerous new methods in a short time, with unprecedented performance. Several of these models have been developed with the goal of generating sequences in novel regions of the protein space. In this work, we provide an overview of the use of protein generative models, reviewing (1) language models for the design of novel artificial proteins, (2) works that use non-transformer architectures, and (3) applications in directed evolution approaches.
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2023-11-01
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Review
    ISSN 1943-0264
    ISSN (online) 1943-0264
    DOI 10.1101/cshperspect.a041471
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  2. Artikel ; Online: Thoraxdrainage beim Thoraxtrauma – Empfehlungen der interdisziplinären Arbeitsgemeinschaft Thoraxtrauma der Deutschen Gesellschaft für Thoraxchirurgie (DGT) und der Deutschen Gesellschaft für Unfallchirurgie (DGU).

    Becker, Lars / Schulz-Drost, Stefan / Schreyer, Christof / Lindner, Sebastian

    Zentralblatt fur Chirurgie

    2023  Band 148, Heft 1, Seite(n) 57–66

    Abstract: For unstable patients with chest trauma, the chest tube is the method of choice for the treatment of a relevant pneumothorax or haemothorax. In the case of a tension pneumothorax, needle decompression with a cannula of at least 5 cm length should be ... ...

    Titelübersetzung Chest Tube in Thoracic Trauma - Recommendations of the Interdisciplinary Thoracic Trauma Task Group of the German Society for Thoracic Surgery (DGT) and the German Trauma Society (DGU).
    Abstract For unstable patients with chest trauma, the chest tube is the method of choice for the treatment of a relevant pneumothorax or haemothorax. In the case of a tension pneumothorax, needle decompression with a cannula of at least 5 cm length should be performed, directly followed by the insertion of a chest tube. The evaluation of the patient should be performed primarily with a clinical examination, a chest X-ray and sonography, but the gold standard of diagnostic testing is computed tomography (CT).A small-bore chest tube (e.g. 14 French) should be used in stable patients, while unstable patients should receive a large-bore drain (24 French or larger). Insertion of chest drains has a high complication rate of between 5% and 25%, and incorrect positioning of the tube is the most common complication. However, incorrect positioning can usually only be reliably detected or ruled out with a CT scan, and chest X-rays proofed to be insufficient to answer this question. Therapy should be carried out with mild suction of approximately 20 cmH
    Mesh-Begriff(e) Humans ; Thoracic Surgery ; Chest Tubes ; Thoracic Surgical Procedures ; Thoracic Injuries/diagnostic imaging ; Thoracic Injuries/surgery ; Hemothorax/diagnostic imaging ; Hemothorax/etiology
    Sprache Deutsch
    Erscheinungsdatum 2023-02-27
    Erscheinungsland Germany
    Dokumenttyp English Abstract ; Journal Article
    ZDB-ID 200935-3
    ISSN 1438-9592 ; 0044-409X
    ISSN (online) 1438-9592
    ISSN 0044-409X
    DOI 10.1055/a-1975-0243
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  3. Buch ; Online: Exploring the Protein Sequence Space with Global Generative Models

    Romero-Romero, Sergio / Lindner, Sebastian / Ferruz, Noelia

    2023  

    Abstract: Recent advancements in specialized large-scale architectures for training image and language have profoundly impacted the field of computer vision and natural language processing (NLP). Language models, such as the recent ChatGPT and GPT4 have ... ...

    Abstract Recent advancements in specialized large-scale architectures for training image and language have profoundly impacted the field of computer vision and natural language processing (NLP). Language models, such as the recent ChatGPT and GPT4 have demonstrated exceptional capabilities in processing, translating, and generating human languages. These breakthroughs have also been reflected in protein research, leading to the rapid development of numerous new methods in a short time, with unprecedented performance. Language models, in particular, have seen widespread use in protein research, as they have been utilized to embed proteins, generate novel ones, and predict tertiary structures. In this book chapter, we provide an overview of the use of protein generative models, reviewing 1) language models for the design of novel artificial proteins, 2) works that use non-Transformer architectures, and 3) applications in directed evolution approaches.

    Comment: 16 pages, 4 figures, 2 tables
    Schlagwörter Quantitative Biology - Biomolecules ; Computer Science - Machine Learning
    Thema/Rubrik (Code) 004
    Erscheinungsdatum 2023-05-03
    Erscheinungsland us
    Dokumenttyp Buch ; Online
    Datenquelle BASE - Bielefeld Academic Search Engine (Lebenswissenschaftliche Auswahl)

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  4. Artikel ; Online: Okkulter und residueller Hämatothorax nach Thoraxtrauma – Empfehlungen der interdisziplinären Arbeitsgruppe Thoraxtrauma der Sektion NIS der Deutschen Gesellschaft für Unfallchirurgie (DGU) und der Deutschen Gesellschaft für Thoraxchirurgie (DGT).

    Krämer, Sebastian / Graeff, Pascal / Lindner, Sebastian / Walles, Thorsten / Becker, Lars

    Zentralblatt fur Chirurgie

    2022  Band 148, Heft 1, Seite(n) 67–73

    Abstract: The management of occult and retained haemothorax is challenging for all involved in the care of polytrauma patients in terms of diagnosis and treatment. The focus of decision making is preventing sequelae such as pleural empyema and avoiding a trapped ... ...

    Titelübersetzung Occult and Retained Haemothorax - Recommendations of the Interdisciplinary Thoracic Trauma Task Group of the German Trauma Society (DGU - Section NIS) and the German Society for Thoracic Surgery (DGT).
    Abstract The management of occult and retained haemothorax is challenging for all involved in the care of polytrauma patients in terms of diagnosis and treatment. The focus of decision making is preventing sequelae such as pleural empyema and avoiding a trapped lung. An interdisciplinary task force of the German Society for Thoracic Surgery (DGT) and the German Trauma Society (DGU) on thoracic trauma offers recommendations for post-trauma care of patients with occult and/or retained haemothorax, as based on a comprehensive literature review.
    Mesh-Begriff(e) Humans ; Thoracic Surgery ; Hemothorax/surgery ; Thoracic Injuries/surgery ; Multiple Trauma/diagnosis ; Thoracic Surgical Procedures ; Germany
    Sprache Deutsch
    Erscheinungsdatum 2022-12-05
    Erscheinungsland Germany
    Dokumenttyp Review ; English Abstract ; Journal Article
    ZDB-ID 200935-3
    ISSN 1438-9592 ; 0044-409X
    ISSN (online) 1438-9592
    ISSN 0044-409X
    DOI 10.1055/a-1972-3352
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  5. Artikel: [Titelangabe fehlt]

    Becker, Lars / Schulz-Drost, Stefan / Schreyer, Christof / Lindner, Sebastian

    Zentralblatt für Chirurgie - Zeitschrift für Allgemeine, Viszeral-, Thorax- und Gefäßchirurgie

    2023  Band 148, Heft 01, Seite(n) 57–66

    Abstract: Die Anlage einer Thoraxdrainage ist zwar grundsätzlich eine einfache, aber oft lebensrettende Notfallmaßnahme. Trotz der Häufigkeit der Prozedur zeigen sich jedoch Unsicherheiten im Umgang mit daraus resultierend hoher Komplikationsrate. Für ... ...

    Abstract Die Anlage einer Thoraxdrainage ist zwar grundsätzlich eine einfache, aber oft lebensrettende Notfallmaßnahme. Trotz der Häufigkeit der Prozedur zeigen sich jedoch Unsicherheiten im Umgang mit daraus resultierend hoher Komplikationsrate. Für alle Beteiligten stellt sowohl die Diagnostik, die Indikationsstellung und die Anlage selbst, wie auch das nachfolgende Management der Drainage eine wiederkehrende Herausforderung dar. Die Unter-AG Lungenverletzung der interdisziplinären AG (Arbeitsgemeinschaft) Thoraxtrauma der Deutschen Gesellschaft für Thoraxchirurgie (DGT) und Deutschen Gesellschaft für Unfallchirurgie (DGU) erarbeitete konsensuelle Behandlungsempfehlungen basierend auf einer Systematic-Review-like Literaturrecherche (MEDLINE via PubMed von 1997 bis 2022). Mit der aktuell vorliegenden Recherche konnten 60 repräsentative Arbeiten identifiziert werden, die Empfehlungen zulassen, jedoch meist nur einen niedrigen Evidenzgrad aufweisen. Die Empfehlungen sind nicht mit Evidenzgraden hinterlegt, sondern haben zunächst Konsenscharakter. Für den instabilen Patienten mit Thoraxtrauma stellt die Thoraxdrainage das Mittel der Wahl zur Entlastung eines Pneumothorax oder Hämatothorax dar. Beim Spannungspneumothorax sollte eine initiale Entlastungspunktion mit einer mindestens 5 cm langen Kanüle, gefolgt von der Anlage einer Thoraxdrainage erfolgen. Diagnostik und Beurteilung des Patienten sollten primär und im Verlauf durch die klinische Untersuchung, eine Röntgenuntersuchung des Thorax sowie eine Thoraxsonografie erfolgen, Goldstandard der Diagnostik ist jedoch die Computertomografie (CT). Beim kreislaufstabilen Patienten soll eine kleinlumige Drainage (z. B. 14 Charrière [Charr]) verwendet werden, instabile Patienten sollten eine großlumige Drainage erhalten. Thoraxdrainagen besitzen eine hohe Komplikationsrate zwischen 5% und 25%. Häufig sind insbesondere Fehlpositionierungen im Rahmen der Anlage. Eine Fehllage kann jedoch meist nur im CT sicher erkannt oder ausgeschlossen werden. Eine Therapie sollte mit mildem Sog erfolgen, ein Abklemmen vor Entfernung ist nicht zielführend. Der Drainagenzug kann sowohl am Ende der Inspiration oder Exspiration sicher erfolgen. Zur Verringerung der hohen Komplikationsrate sollte vermehrt der Fokus auf die Ausbildung und das Training der Anwender gelegt werden.
    Schlagwörter Thoraxdrainage ; Thoraxchirurgie ; Thoraxtrauma ; chest tube ; thoracic surgery ; thoracic trauma ; chest drain
    Sprache Deutsch
    Erscheinungsdatum 2023-02-01
    Verlag Georg Thieme Verlag KG
    Erscheinungsort Stuttgart ; New York
    Dokumenttyp Artikel
    ZDB-ID 200935-3
    ISSN 1438-9592 ; 0044-409X
    ISSN (online) 1438-9592
    ISSN 0044-409X
    DOI 10.1055/a-1975-0243
    Datenquelle Thieme Verlag

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  6. Buch ; Dissertation / Habilitation: Zwischen Öffnung und Abgrenzung

    Lindner, Sebastian

    die Geschichte des innerdeutschen Kulturabkommens 1973-1986

    (Forschungen zur DDR-Gesellschaft)

    2015  

    Körperschaft Christoph Links Verlag
    Verfasserangabe Sebastian Lindner
    Serientitel Forschungen zur DDR-Gesellschaft
    Schlagwörter Kulturpolitik ; Kulturbeziehungen ; Kulturabkommen ; Deutschland
    Sprache Deutsch
    Umfang 248 S., 210 mm x 148 mm
    Verlag Links
    Erscheinungsort Berlin
    Dokumenttyp Buch ; Dissertation / Habilitation
    Dissertation / Habilitation Univ., Diss.--Leipzig, 2012
    Anmerkung Literaturverz. S. 238-244
    ISBN 3861538601 ; 9783861538608
    Datenquelle Ehemaliges Sondersammelgebiet Küsten- und Hochseefischerei

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  7. Buch ; Online ; Dissertation / Habilitation: An information system for predicting the influx of spontaneous volunteers at operating sites in natural disasters

    Lindner, Sebastian [Verfasser] / Sackmann, Stefan [Gutachter] / Peters, Ralf [Gutachter]

    2022  

    Verfasserangabe Sebastian Lindner ; Gutachter: Stefan Sackmann, Ralf Peters
    Schlagwörter Soziale Probleme, Sozialarbeit ; Social problems, Social work
    Thema/Rubrik (Code) sg360
    Sprache Englisch
    Verlag Universitäts- und Landesbibliothek Sachsen-Anhalt
    Erscheinungsort Halle (Saale)
    Dokumenttyp Buch ; Online ; Dissertation / Habilitation
    Datenquelle Digitale Dissertationen im Internet

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  8. Artikel: [Titelangabe fehlt]

    Krämer, Sebastian / Graeff, Pascal / Lindner, Sebastian / Walles, Thorsten / Becker, Lars

    Zentralblatt für Chirurgie - Zeitschrift für Allgemeine, Viszeral-, Thorax- und Gefäßchirurgie

    2022  Band 148, Heft 01, Seite(n) 67–73

    Abstract: Der Versorgung okkulter und residueller Hämatothoraces (synonym retinierte/residuale Hämothoraces) stellt für die an der Polytraumaversorgung Beteiligten sowohl in Aspekten der Diagnostik als auch der Therapie eine wiederkehrende ... ...

    Abstract Der Versorgung okkulter und residueller Hämatothoraces (synonym retinierte/residuale Hämothoraces) stellt für die an der Polytraumaversorgung Beteiligten sowohl in Aspekten der Diagnostik als auch der Therapie eine wiederkehrende Herausforderung dar. Diese ergibt sich selten aus einer unmittelbaren Notfallsituation, sondern vielmehr daraus, wie mögliche Folgeerscheinungen eines Pleuraempyems und einer fixierten Lunge vermieden werden können. Die interdisziplinäre Arbeitsgruppe der Deutschen Gesellschaft für Thoraxchirurgie (DGT) und Deutschen Gesellschaft für Unfallchirurgie (DGU) zur Thoraxtraumaversorgung unterstützt die Ausarbeitung einer Empfehlung basierend auf einer umfassenden Literaturrecherche.
    Schlagwörter Hämatothorax ; Thoraxtrauma ; Polytrauma ; Pleuraempyem ; Thoraxdrainage ; hemothorax ; thoracic trauma ; pleural empyema ; chest tube ; retained hemothorax
    Sprache Deutsch
    Erscheinungsdatum 2022-12-05
    Verlag Georg Thieme Verlag KG
    Erscheinungsort Stuttgart ; New York
    Dokumenttyp Artikel
    ZDB-ID 200935-3
    ISSN 1438-9592 ; 0044-409X
    ISSN (online) 1438-9592
    ISSN 0044-409X
    DOI 10.1055/a-1972-3352
    Datenquelle Thieme Verlag

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  9. Buch ; Dissertation / Habilitation: Die Mühen der Ebene

    Lindner, Sebastian

    die Verhandlungen zum Kulturabkommen zwischen der Bundesrepublik Deutschland und der DDR 1973 - 1986

    2012  

    Verfasserangabe vorgelegt von Sebastian Lindner
    Sprache Deutsch
    Umfang III, 325 Bl.
    Dokumenttyp Buch ; Dissertation / Habilitation
    Dissertation / Habilitation Univ., Diss.--Leipzig, 2012
    Datenquelle Ehemaliges Sondersammelgebiet Küsten- und Hochseefischerei

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  10. Buch ; Online: A Tutorial on Trace-based Simulations of Mobile Ad-hoc Networks on the Example of Aeronautical Communications

    Ahmed, Musab Ahmed Eltayeb / Fuger, Konrad / Lindner, Sebastian / Khan, Fatema / Timm-Giel, Andreas

    2021  

    Abstract: The OMNeT++ simulator is well-suited for the simulation of randomized user behavior in communication networks. However, there are scenarios, where such a random model is unsuited to evaluate a communication system, and this paper attempts to highlight ... ...

    Abstract The OMNeT++ simulator is well-suited for the simulation of randomized user behavior in communication networks. However, there are scenarios, where such a random model is unsuited to evaluate a communication system, and this paper attempts to highlight such a case. Using this example of ad-hoc communication between aircraft mid-flight, a tutorial-style description is attempted that shall show how the OMNeT++ simulator can be used when a wealth of real-world trace data is available. In particular, it is described how mobility trace files can be directly used within OMNeT++, and how to link the generation of data messages to this mobility data. This is explained via an example simulation that evaluates a communication network in which an aircraft notifies the ground control when it enters or leaves a specific geographic region. Additionally, a novel trace-based application has been developed to achieve this link between mobility and message generation. Furthermore, a new TDMA-based medium access protocol for decentralized communication networks is presented, which is oracle-based and thus allows a TDMA-like behavior of medium access without causing any overhead; it can be useful when upper-layer protocols should be evaluated under the assumption of TDMA-like behavior, but isolated from the effects of a full-fledged TDMA protocol. Finally, physical layer behavior is often either overly simplistic or overly computationally expensive. For the latter case, when a detailed channel model is available but its evaluation requires prohibitive computational effort, then averaging its behavior into trace data can find a middle ground between efficient evaluation and realistic representation. Hence, a novel trace-based radio model has been developed that makes use of an SNR to PER mapping. In the spirit of open science, all implementations have been made available under open licenses.

    Comment: Published in: M. Marek, G. Nardini, V. Vesely (Eds.), Proceedings of the 8th OMNeT++ Community Summit, Virtual Summit, September 8-10, 2021
    Schlagwörter Computer Science - Networking and Internet Architecture ; Computer Science - Performance
    Thema/Rubrik (Code) 000
    Erscheinungsdatum 2021-09-27
    Erscheinungsland us
    Dokumenttyp Buch ; Online
    Datenquelle BASE - Bielefeld Academic Search Engine (Lebenswissenschaftliche Auswahl)

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    Kategorien

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