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  1. Buch ; Online: Data Parallel C++

    Reinders, James / Ashbaugh, Ben / Brodman, James / Kinsner, Michael / Pennycook, John / Tian, Xinmin

    Programming Accelerated Systems Using C++ and SYCL

    2023  

    Verfasserangabe by James Reinders, Ben Ashbaugh, James Brodman, Michael Kinsner, John Pennycook, Xinmin Tian
    Schlagwörter Compilers (Computer programs) ; Makerspaces
    Sprache Englisch
    Umfang 1 Online-Ressource (XXX, 630 p. 329 illus., 294 illus. in color)
    Ausgabenhinweis 2nd ed. 2023
    Verlag Apress ; Imprint: Apress
    Erscheinungsort Berkeley, CA
    Dokumenttyp Buch ; Online
    HBZ-ID HT030389765
    ISBN 978-1-4842-9691-2 ; 9781484296905 ; 9781484296929 ; 1-4842-9691-5 ; 1484296907 ; 1484296923
    DOI 10.1007/978-1-4842-9691-2
    Datenquelle ZB MED Katalog Medizin, Gesundheit, Ernährung, Umwelt, Agrar

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  2. Buch ; Online: Data Parallel C++

    Reinders, James / Ashbaugh, Ben / Brodman, James / Kinsner, Michael / Pennycook, John / Tian, Xinmin

    Programming Accelerated Systems Using C++ and SYCL

    2023  

    Schlagwörter Programming & scripting languages: general ; Computer hardware ; heterogenous ; FPGA programming ; GPU programming ; Parallel programming ; Data parallelism ; SYCL ; Intel One API
    Sprache Englisch
    Umfang 1 electronic resource (630 pages)
    Verlag Springer Nature
    Erscheinungsort Berkeley
    Dokumenttyp Buch ; Online
    Anmerkung English
    HBZ-ID HT030609946
    ISBN 9781484296905 ; 1484296907
    Datenquelle ZB MED Katalog Medizin, Gesundheit, Ernährung, Umwelt, Agrar

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  3. Buch ; Online: Data Parallel C++

    Reinders, James / Ashbaugh, Ben / Brodman, James / Kinsner, Michael / Pennycook, John / Tian, Xinmin

    Mastering DPC++ for Programming of Heterogeneous Systems using C++ and SYCL

    2021  

    Verfasserangabe by James Reinders, Ben Ashbaugh, James Brodman, Michael Kinsner, John Pennycook, Xinmin Tian
    Schlagwörter Programming languages (Electronic computers) ; Computer input-output equipment
    Thema/Rubrik (Code) 005.13
    Sprache Englisch
    Umfang 1 Online-Ressource (XXVI, 548 p. 338 illus., 280 illus. in color)
    Ausgabenhinweis 1st ed. 2021
    Verlag Apress ; Imprint: Apress
    Erscheinungsort Berkeley, CA
    Dokumenttyp Buch ; Online
    HBZ-ID HT020661054
    ISBN 978-1-4842-5574-2 ; 9781484255735 ; 9781484255759 ; 1-4842-5574-7 ; 1484255739 ; 1484255755
    DOI 10.1007/978-1-4842-5574-2
    Datenquelle ZB MED Katalog Medizin, Gesundheit, Ernährung, Umwelt, Agrar

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  4. Buch ; Online: Data Parallel C++ : Mastering DPC++ for Programming of Heterogeneous Systems using C++ and SYCL

    Reinders, James / Ashbaugh, Ben / Brodman, James / Kinsner, Michael / Pennycook, John / Tian, Xinmin

    2021  

    Schlagwörter Programming & scripting languages: general ; Computer hardware ; Programming Languages, Compilers, Interpreters ; Hardware and Maker ; Maker ; heterogenous ; FPGA programming ; GPU programming ; Parallel programming ; Data parallelism ; SYCL ; Intel One API ; Compilers & interpreters
    Umfang 1 electronic resource (548 pages)
    Verlag Springer Nature
    Dokumenttyp Buch ; Online
    Anmerkung English ; Open Access
    HBZ-ID HT021029576
    ISBN 978-1-4842-5574-2 ; 1-4842-5574-7
    Datenquelle ZB MED Katalog Medizin, Gesundheit, Ernährung, Umwelt, Agrar

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  5. Artikel ; Online: [Characteristics of the chloroplast genome of

    Turdi, Rayhangul / Mu, Lihong / Tian, Xinmin

    Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology

    2022  Band 38, Heft 8, Seite(n) 2999–3013

    Abstract: In order to characterize the chloroplast genome and phylogenetic relationships ... ...

    Abstract In order to characterize the chloroplast genome and phylogenetic relationships of
    Mesh-Begriff(e) Codon ; Genome, Chloroplast/genetics ; Microsatellite Repeats ; Phylogeny ; Ranunculaceae/genetics
    Chemische Substanzen Codon
    Sprache Chinesisch
    Erscheinungsdatum 2022-08-25
    Erscheinungsland China
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 1042206-7
    ISSN 1872-2075 ; 1042-749X
    ISSN (online) 1872-2075
    ISSN 1042-749X
    DOI 10.13345/j.cjb.210876
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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    Verfügbar in ZB MED Köln/Königswinter

    Zs.A 3505: Hefte anzeigen Standort:
    Je nach Verfügbarkeit (siehe Angabe bei Bestand)
    bis Jg. 1994: Bestellungen von Artikeln über das Online-Bestellformular
    Jg. 1995 - 2021: Lesesall (2.OG)
    ab Jg. 2022: Lesesaal (EG)

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  6. Artikel ; Online: Metabolomic analysis reveals key metabolites and metabolic pathways in <i>Suaeda salsa</i> under salt and drought stress

    Bao, Jinbo / Liu, Zhiyou / Ding, Zhijie / Yisilam, Gulbar / Wang, Qiuyan / Tian, Xinmin

    Functional Plant Biology. 2023, v. 50, no. 9 p.701-711

    2023  

    Abstract: Suaeda salsa is an important salt- and drought-tolerant plant with important ecological restoration roles. However, little is known about its underlying molecular regulatory mechanisms. Therefore, understanding the response mechanisms of plants to salt ... ...

    Abstract Suaeda salsa is an important salt- and drought-tolerant plant with important ecological restoration roles. However, little is known about its underlying molecular regulatory mechanisms. Therefore, understanding the response mechanisms of plants to salt and drought stress is of great importance. In this study, metabolomics analysis was performed to evaluate the effects of salt and drought stress on S. salsa . The experiment consisted of three treatments: (1) control (CK); (2) salt stress (Ps); and (3) drought stress (Pd). The results showed that compared with the control group, S. salsa showed significant differences in phenotypes under salt and drought stress conditions. First, a total of 207 and 292 differential metabolites were identified in the Ps/CK and Pd/CK groups, respectively. Second, some soluble sugars and amino acids, such as raffinose, maltopentoses, D -altro-beptulose, D -proline, valine-proline, proline, tryptophan and glycine-L -leucine, showed increased activity under salt and drought stress conditions, suggesting that these metabolites may be responsible for salt and drought resistance in S. salsa . Third, the flavonoid biosynthetic and phenylalanine metabolic pathways were significantly enriched under both salt and drought stress conditions, indicating that these two metabolic pathways play important roles in salt and drought stress resistance in S. salsa . The findings of this study provide new insights into the salt and drought tolerance mechanisms of S. salsa .
    Schlagwörter Suaeda salsa ; biosynthesis ; drought tolerance ; ecological restoration ; flavonoids ; metabolites ; metabolomics ; phenylalanine ; proline ; raffinose ; salt stress ; stress tolerance ; tryptophan ; water stress ; abiotic ; enrichment ; metabolic profiling ; osmoregulation ; pathways ; stress response ; tolerance
    Sprache Englisch
    Umfang p. 701-711.
    Erscheinungsort CSIRO Publishing
    Dokumenttyp Artikel ; Online
    ZDB-ID 2071582-1
    ISSN 1445-4408
    ISSN 1445-4408
    DOI 10.1071/FP23049
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

    Volltext online

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    Verfügbar in ZB MED Bonn

    Z 4753: Hefte anzeigen

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  7. Artikel ; Online: Transcriptomic study of <i>Suaeda salsa</i> in response to salt and drought stress

    Ding, Zhijie / Liu, Zhiyou / Bao, Jinbo / Wang, Yuwei / Li, Jialei / Wang, Qiuyan / Tian, Xinmin

    Functional Plant Biology. 2023, v. 50, no. 10 p.765-776

    2023  

    Abstract: Drought and salinity are the main factors limiting agricultural production. Improving crop resistance to relieve land stress is a major challenge in agriculture. The salt-tolerant species Suaeda salsa is a typical indicator of saline soil. It has a ... ...

    Abstract Drought and salinity are the main factors limiting agricultural production. Improving crop resistance to relieve land stress is a major challenge in agriculture. The salt-tolerant species Suaeda salsa is a typical indicator of saline soil. It has a strong drought tolerance and can be used as a model plant to study salt and drought tolerance in plants. In this study, transcriptome sequencing and bioinformatic analysis were performed to study gene expression changes in S. salsa under salt and drought stresses, and to screen out differentially expressed genes. The genetic changes were most abundant in cellular processes, metabolic processes, ion binding, signalling, post-translational modifications, protein conversion, and molecular chaperones, suggesting that the above methods may play a significant role in the response of S. salsa to external salt and drought stress. Enrichment analysis showed that carbohydrate metabolic processes, oxidoreductase activity, transmembrane transport, kinase activity, cellular protein modification processes, and ion-binding pathways are involved in the stress response of S. salsa .
    Schlagwörter Suaeda salsa ; bioinformatics ; carbohydrates ; drought ; drought tolerance ; gene expression ; gene expression regulation ; plant biology ; saline soils ; salinity ; salt tolerance ; stress response ; transcriptome ; transcriptomics ; water stress ; differentially expressed genes ; drought stress ; RNA-seq ; salt stress ; signalling pathway ; stress tolerance mechanism ; Suaeda salsa ; transcriptome</kwd>
    Sprache Englisch
    Umfang p. 765-776.
    Erscheinungsort CSIRO Publishing
    Dokumenttyp Artikel ; Online
    ZDB-ID 2071582-1
    ISSN 1445-4408
    ISSN 1445-4408
    DOI 10.1071/FP23050
    Datenquelle NAL Katalog (AGRICOLA)

    Volltext online

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    Verfügbar in ZB MED Bonn

    Z 4753: Hefte anzeigen

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  8. Artikel: Comparative analyses of chloroplast genomes in 'Red Fuji' apples: low rate of chloroplast genome mutations.

    Miao, Haoyu / Bao, Jinbo / Li, Xueli / Ding, Zhijie / Tian, Xinmin

    PeerJ

    2022  Band 10, Seite(n) e12927

    Abstract: Background: Fuji is a vital apple cultivar, and has been propagated clonally for nearly a century. The chloroplast genome variation of Fuji apples in China has not been investigated.: Methods: This study used next-generation high-throughput ... ...

    Abstract Background: Fuji is a vital apple cultivar, and has been propagated clonally for nearly a century. The chloroplast genome variation of Fuji apples in China has not been investigated.
    Methods: This study used next-generation high-throughput sequencing and bioinformatics to compare and analyze the chloroplast genome of 24 Red Fuji varieties from nine regions in China.
    Results: The results showed that the 24 chloroplast genomes were highly conserved in genome size, structure, and organization. The length of the genomes ranged from 160,063 to 160,070 bp, and the GC content was 36.6%. Each of the 24 chloroplast genomes encoded 131 genes, including 84 protein-coding genes, 37 tRNA genes, and eight rRNA genes. The results of repeat sequence detection were consistent; the most common sequence was forward repeats (53.1%), and the least common sequence was complementary repeats (4.1%). The chloroplast genome sequence of Red Fuji was highly conserved. Two indels were detected, but the PI value was 0, and there were no SNP loci. The chloroplast genome variation rate of Red Fuji was low.
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2022-02-21
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 2703241-3
    ISSN 2167-8359
    ISSN 2167-8359
    DOI 10.7717/peerj.12927
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  9. Artikel: Complete chloroplast genome studies of different apple varieties indicated the origin of modern cultivated apples from

    Li, Xueli / Ding, Zhijie / Miao, Haoyu / Bao, Jinbo / Tian, Xinmin

    PeerJ

    2022  Band 10, Seite(n) e13107

    Abstract: Background: Apple is one of the most important temperate deciduous fruit trees worldwide, with a wide range of cultivation. In this study, we assessed the variations and phylogenetic relationships between the complete chloroplast genomes of wild and ... ...

    Abstract Background: Apple is one of the most important temperate deciduous fruit trees worldwide, with a wide range of cultivation. In this study, we assessed the variations and phylogenetic relationships between the complete chloroplast genomes of wild and cultivated apples (
    Method: We obtained the complete chloroplast genomes of 24 apple varieties using next-generation sequencing technology and compared them with genomes of (downloaded from NCBI) the wild species.
    Result: The chloroplast genome of
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2022-03-18
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article
    ZDB-ID 2703241-3
    ISSN 2167-8359
    ISSN 2167-8359
    DOI 10.7717/peerj.13107
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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  10. Artikel ; Online: Assembly and comparative analysis of the complete mitochondrial genome of Isopyrum anemonoides (Ranunculaceae).

    Yisilam, Gulbar / Liu, Zhiyou / Turdi, Rayhangul / Chu, Zhenzhou / Luo, Wei / Tian, Xinmin

    PloS one

    2023  Band 18, Heft 10, Seite(n) e0286628

    Abstract: Ranunculaceae is a large family of angiosperms comprising 2500 known species-a few with medicinal and ornamental values. Despite this, only two mitochondrial genomes (mitogenomes) of the family have been released in GenBank. Isopyrum anemonoides is a ... ...

    Abstract Ranunculaceae is a large family of angiosperms comprising 2500 known species-a few with medicinal and ornamental values. Despite this, only two mitochondrial genomes (mitogenomes) of the family have been released in GenBank. Isopyrum anemonoides is a medicinal plant belonging to the family Ranunculaceae, and its chloroplast genome has recently been reported; however, its mitogenome remains unexplored. In this study, we assembled and analyzed the complete mitochondrial genome of I. anemonoides and performed a comparative analysis against different Ranunculaceae species, reconstructing the phylogenetic framework of Isopyrum. The circular mitogenome of I. anemonoides has a length of 206,722 bp, with a nucleotide composition of A (26.4%), T (26.4%), C (23.6%), and G (23.6%), and contains 62 genes, comprising 37 protein-coding genes (PCGs), 22 transfer RNA (tRNA) genes, and three ribosomal RNA (rRNA) genes. Abundantly interspersed repetitive and simple sequence repeat (SSR) loci were detected in the I. anemonoides mitogenome, with tetranucleotide repeats accounting for the highest proportion of SSRs. By detecting gene migration, we observed gene exchange between the chloroplast and mitogenome in I. anemonoides, including six intact tRNA genes, six PCG fragments, and fragments from two rRNA genes. Comparative mitogenome analysis of three Ranunculaceae species indicated that the PCG contents were conserved and the GC contents were similar. Selective pressure analysis revealed that only two genes (nad1 and rpl5) were under positive selection during their evolution in Ranunculales, and two specific RNA editing sites (atp6 and mttB) were detected in the I. anemonoides mitogenome. Moreover, a phylogenetic analysis based on the mitogenomes of I. anemonoides and the other 15 taxa accurately reflected the evolutionary and taxonomic status of I. anemonoides. Overall, this study provides new insights into the genetics, systematics, and evolution of mitochondrial evolution in Ranunculaceae, particularly I. anemonoides.
    Mesh-Begriff(e) Phylogeny ; Genome, Mitochondrial/genetics ; Ranunculaceae/genetics ; Nucleotides ; RNA, Transfer/genetics
    Chemische Substanzen Nucleotides ; RNA, Transfer (9014-25-9)
    Sprache Englisch
    Erscheinungsdatum 2023-10-05
    Erscheinungsland United States
    Dokumenttyp Journal Article ; Research Support, Non-U.S. Gov't
    ZDB-ID 2267670-3
    ISSN 1932-6203 ; 1932-6203
    ISSN (online) 1932-6203
    ISSN 1932-6203
    DOI 10.1371/journal.pone.0286628
    Datenquelle MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE

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