Artikel ; Online: Weighted ensemble: Recent mathematical developments.
The Journal of chemical physics
2023 Band 158, Heft 1, Seite(n) 14108
Abstract: Weighted ensemble (WE) is an enhanced sampling method based on periodically replicating and pruning trajectories generated in parallel. WE has grown increasingly popular for computational biochemistry problems due, in part, to improved hardware and ... ...
Abstract | Weighted ensemble (WE) is an enhanced sampling method based on periodically replicating and pruning trajectories generated in parallel. WE has grown increasingly popular for computational biochemistry problems due, in part, to improved hardware and accessible software implementations. Algorithmic and analytical improvements have played an important role, and progress has accelerated in recent years. Here, we discuss and elaborate on the WE method from a mathematical perspective, highlighting recent results that enhance the computational efficiency. The mathematical theory reveals a new strategy for optimizing trajectory management that approaches the best possible variance while generalizing to systems of arbitrary dimension. |
---|---|
Mesh-Begriff(e) | Algorithms ; Software |
Sprache | Englisch |
Erscheinungsdatum | 2023-01-06 |
Erscheinungsland | United States |
Dokumenttyp | Journal Article |
ZDB-ID | 3113-6 |
ISSN | 1089-7690 ; 0021-9606 |
ISSN (online) | 1089-7690 |
ISSN | 0021-9606 |
DOI | 10.1063/5.0110873 |
Datenquelle | MEDical Literature Analysis and Retrieval System OnLINE |
Zusatzmaterialien
Kategorien
Verfügbar in ZB MED Bonn
Z 4' 49/16: Hefte anzeigen |
Über subito bestellen
Dieser Service ist kostenpflichtig (siehe Lieferbedingungen von subito). Bestellungen, die einen Artikel nebst Supplementary Material umfassen, werden grundsätzlich wie mehrfache Bestellungen bearbeitet. Gebühren fallen in diesen Fällen für jede einzelne Bestellung an.
Fernleihe an ZB MED
Sie können sich den gewünschten Titel als lokale Nutzerin oder lokaler Nutzer von ZB MED direkt an den Standort Köln schicken lassen.